Pseudomonas
Pseudomonas
Pseudomonas aeruginosa ved Gram-farvning
| Reger | Bakterie |
|---|---|
| Division | Proteobakterier |
| Klasse | Gammaproteobakterier |
| Bestille | Pseudomonadales |
| Familie | Pseudomonadaceae |
Migula , 1894
De bakterier af slægten Pseudomonas kan defineres ved:
- Baciller til gramnegative , oxidase +;
- Strenge aerobes ( "nitratånding" hos nogle arter );
- Nedbrydende glukose ved aerob eller inaktiv respiration med hensyn til glukose . De angriber ikke sukker eller angriber dem oxidativt og ikke fermentativt ;
- Normalt mobil med polær ciliature (monotrich eller lophotriche);
- Undemanding, vokser fra 0 til 30 ° C ;
- Indol -;
- Asporulerer;
- Kolonier er ofte pigmenterede.
I de tidlige 2000'ere blev Pseudomonaceae-familien anset for at være sandsynligvis den mest rigelige og udbredte livsform på planeten. Denne slægt omfatter mere end hundrede allestedsnærværende arter (hvoraf typen er Pseudomonas aeruginosa , generelt kaldet Bacillus pyocyanis ). Imidlertid reduceres dette tal, fordi fremskridt inden for fylogenetik gør det muligt at forfine klassificeringen. Vi har tendens til tres arter.
Habitat
Disse bakterier, der er bredt fordelt i miljøet, lever i jorden og i frisk, salt og brak, overflade- og underjordisk vand og findes endda i live for visse stammer i tågerne , i regnen eller i skyerne indtil over 10 km højde . De findes på planter i ikke-levende organisk materiale (fødevarer), hvilket nogle gange fører til deres organoleptiske forringelse . Mennesker har øget deres levesteder, herunder gennem luft-, sø- og flodtransport og ind i undergrunden via hydraulisk frakturering, fordi det også findes i boreslam og brudvæsker .
De findes hos mennesker eller dyr i næsehulen og i tarmen. De udgør for det meste en kommensflora .
Nogle spiller en patogen rolle:
- i planter (nogle få arter, herunder Pseudomonas syringae , hvoraf den ene stamme tusindvis har dræbt eller syggjort unge kastanjetræer siden begyndelsen af 2000'erne);
- hos mennesker og dyr (hovedsageligt med Pseudomonas aeruginosa ).
De indtager forskellige økologiske nicher, men findes mere specifikt i fugtige miljøer som ferskvand, havvand, termisk vand. De findes i mindre mængder i vand rig på organisk materiale (især stillestående vand) som et resultat af konkurrence mellem mikroorganismer, hvor Pseudomonas ikke er den mest effektive. I hjem findes de således i siphoner, vand fra regnvandreservoirer, som, når de bruges til vanding af planter, kan forårsage sygdomme på planter, især blomster (for fytopatogene arter).
Økologiske specificiteter
Den meget allestedsnærværende natur af Pseudomonas er knyttet til usædvanlige tilpasningskapaciteter i bakterier, der gør det muligt for dem hurtigt at tilpasse sig et stort antal miljøer og vanskelige levevilkår; Nogle stammer af pseudomonas aeruginosa er blandt de mikrober, der vides at være de mest resistente over for antibiotika
- Deres genom (for nylig sekventeret: 6,3 Mbp og et GC-indhold på 66%) er et af de største i bakterieverdenen. Den indeholder 5570 åbne læserammer og indeholder den højeste andel af kendte regulatoriske gener. Et batteri af gener til katabolisme , transport og udstrømning og kemotaxis gør dem i stand til at modstå mange stressfaktorer; de har mere end 300 forskellige næringsstoftransportsystemer;
- De kan leve med eller uden ilt (under anaerobe forhold bruger de nitrater som den sidste elektronacceptor) og i alle miljøer og i en lang række temperaturer og tryk.
- De har mange fodringsmekanismer;
- De er aktivt mobile;
- De er udstyret med mindst 55 detektorproteinkinaser, 89 transkriptionsfaktorer og 14 detektor / regulatoriske fusionsproteiner; så mange sensorer og "værktøjer", der giver dem mulighed for at finde forskellige næringskilder ( kemotaxis );
- Deres membran er modstandsdygtig (for eksempel relativt god modstandsdygtighed over for sol-UV-stråler), og deres membranpermeabilitet er lav, hvilket forstærker deres modstandsdygtighed over for eksterne belastninger;
- Visse arter (især P. aeruginosa ) udskiller kraftige fungicidforbindelser, der tillader dem at modstå svampeanfald, mens de får adgang til ernæringsmæssige ressourcer uden at konkurrere med svampe;
- De har en bred vifte af poriner og efflukspumper, der giver dem mulighed for at kontrollere deres indre miljø og evakuere adskillige antibiotikamolekyler, som er forstyrrende eller unødvendige, udefra (Walsh 2003).
- De har adhæsiner, LPS, et type III-sekretionssystem, udskiller ExoS- og ExoU-toksiner, elastase og et alginat, der tillader dem at danne meget resistente biofilm.
Biologisk nedbrydning
Mange stammer af Pseudomonas spiller en vigtig rolle i biologisk nedbrydningsprocesser . I processerne til sanering og behandling af forurenede steder kan biologisk nedbrydning begunstiges eller fremskyndes af næringsstofindgange eller af udvalgte bakteriestammer. Dette er f.eks. Tilfældet med jord- eller vandforurening med brændselsolie eller råolie. I dette tilfælde har såning med blandede stammer af Pseudomonas og Rhodococcus vist sig at være mere effektiv til nedbrydning af brændselsolie i vandmiljø. I sidstnævnte tilfælde har vi undladt at forbedre ydeevnen af bakterierne ved at øge foreningen til tre, fire eller fem stammer af andre bakterier.
Svamp / bakterieforeningen er også meget almindelig for nedbrydning af organisk stof eller i visse patogene processer (superinfektion).
Patogen rolle
Hos mennesker forekommer arten Pseudomonas aeruginosa (også kaldet pyocyanic bacillus) ofte som et opportunistisk patogen . Det findes i transitflora på huden og slimhinderne og forårsager sekundære infektioner i sår eller forbrændinger. Hos immunkompromitterede individer kan det være årsagen til forskellige hud- og viscerale infektioner eller endda sepsis . Det har en særlig høj risiko for nosokomielle infektioner (kontraheret gennem hospitalsbehandling), især med stammer, der er resistente over for visse almindelige antibiotika.
De andre bakterier er ikke særlig aggressive i sig selv, men opfører sig generelt som "opportunistiske" bakterier, der udnytter unormale implantationsbetingelser hos svækkede individer, hvilket skaber substitutionsflora eller alvorlige infektioner ved utilsigtet introduktion i kroppen (kateterisering, baxter, meningsmålinger osv.). Deres rolle har fået større betydning i de senere år, især på hospitaler.
Behandling
Antibiotika
Pseudomonas aeruginosas er følsom over for fluoroquinoloner og har normalt ingen problemer med at blive behandlet. Imidlertid bliver nogle stammer antibiotikaresistente. Desværre, på grund af deres multilægemodstandsdygtige natur og den massive anvendelse af antibiotika , er disse stammer blevet kunstigt udvalgt af mennesker og kan ende med at være fremherskende over andre.
Den hospitalsmiljø er det ideelle sted for denne uønskede udvælgelse og Pseudomonas aeruginosa er ansvarlig for mange nosokomielle infektioner .
Fagoterapi
Den fagterapi bruges på mennesker i nogle lande som Rusland og Georgien. I Rusland er der en bakteriofagcocktail specielt designet mod Pseudomonas på apoteker .
I Frankrig er fagterapi kun mulig under midlertidig godkendelse til brug udstedt af ANSM. Pherecydes Pharma har udviklet en bakteriofagcocktail mod P. aeruginosa: P. Aeruginosa PHAGE PP113. Det er den første bakteriofag, der vises på franske lægemiddelhenvisningssteder . Den er kun tilgængelig på ATUn .
Stillet over for manglen på en løsning gennem det traditionelle plejekredsløb er der oprettet patientorganisationer i Frankrig for at lette adgangen til fremmed bakteriofag.
Bakteriologiske tegn
Mikroskopisk morfologi
Udseende : Arten af slægten Pseudomonas er fin, lige Gram-negativ bacilli og meget mobil takket være en polær flagellum : monotrich ciliature, blottet for sporer og kapsler.
Gruppering : de fremstår mesteparten af tiden isoleret eller som diplobaciller.
Kulturkarakterer
DyrkningsbetingelserArten af slægten Pseudomonas er ikke særlig krævende bakterier, langt størstedelen af arten kræver ingen vækstfaktor og er i stand til at bruge som en eneste kilde til kulstof og energi et bredt spektrum af enkle og varierede kulstofholdige substrater.
De udvikler sig i alle almindelige medier , selv de enkleste. De er basisk elskende.
De har også en stor tolerance i de omgivende temperaturområder, selvom de har en optimal væksttemperatur mellem 30 og 35 ° C ( mesofil ), er de i stand til at udvikle sig ved temperaturer mellem 4 og 42 ° C ved at bremse deres stofskifte . Deres vækst hæmmes derfor ikke fuldstændigt af kølerum og inkubatorer.
De er resistente over for mange bakteriehæmmere, især kemiske stoffer. De udvikler sig fortsat i visse antiseptiske opløsninger (især cetrimid ) og er resistente over for mange antibiotika .
Brugte kulturmedier- Ikke-selektive medier
- Selektive medier
Identifikationsmatrix for arter af slægten Pseudomonas
-1 = negativ eller fravær, tegn fraværende i 100% eller til stede i 0%; 1 = positiv eller tilstedeværelse, træk til stede i 100% eller fraværende i 0%; 0 eller ledig plads = variabelt tegn til stede i 50% eller ingen oplysninger
| Venlig | Arter | Undertype / observationer | Oxidase | 42 ° C ( termofil ) | 4 ° C ( kryofil ) | King F (for Fluoresceine = Pyoverdine ) | King P (for Pyocyanin ) | andet pigment | Poly-Beta-hydroxy-butyrat | Mobilitet | ADH = L-arginin-dehydrogenase | NO3 Nitratreduktase (farve)> Nitritter (rød) | Gelatinase = Collagenase | Amylase = Starch Hydrolase | Lecithinase = Reaktion på æggeblomme | Lipase (hydrolyse af Tween80) | NO2> N2 | Ortho-spaltning cathecol | Procathénuate ortho-spaltning | Prokathenuere metaklyvning | Levan (metaklyvning) produktion fra saccharose | D-glukose assimilation | D-Trehalose assimilation | Sucrose assimilation | Propionat assimilation | Assyrering af butyrat | D-sorbitol assimilation | Adonitol assimilation | Meso-inositol assimilation | Geraniol assimilation | L-Valine assimilation | D-Alanine assimilation | L-arginin assimilation | Arginin | Galde-esculinhydrolyse = (Beta-glucosidase) | Simmons Citrate | Trinatrium citrat assimilation | D-glucose fermentering | D-glukose assimilation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Pseudomonas | sp | 0,99 | 0,9 | -0,68 | -1 | -1 | -1 | -0,86 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | aeruginosa | 0,97 | 0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | pyomelanin = sortbrun eller mahogni; pyorubin = aeruginosin A = phenazinisk rød | -1 | 0,94 | 0,7 | 0,92 | 0,84 | -0,9 | -0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,98 | -1 | -1 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,38 | 0,98 | |||
| Pseudomonas | fluorescens | jeg | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 1 | 0,35 | -0,46 | 0,4 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,98 | 1 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,01 | 0,01 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,98 | ||
| Pseudomonas | Putida | 0,98 | -1 | 0,7 | 0,7 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 1 | 0,76 | -0,94 | -1 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | -0,6 | 0,9 | 0,9 | -0,7 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -1 | 0,98 | -0,8 | 0,9 | |||
| Pseudomonas | agarici | uden medicinsk interesse, fytopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | alkaligener | uden medicinsk interesse | 0,97 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | gul-orange ( carotenoid ) | -0,9 | 0,9 | 0,2 | 0,7 | -0,01 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | -0,8 | -1 | 0,9 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -1 | 0,2 | -1 | -0,8 | |||||||
| Pseudomonas | mandler | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | anguiliseptica | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | asplenii | uden medicinsk interesse, fytopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | balearica | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | ||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | caricapapayae | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | chlororaphis | uden medicinsk interesse | 0,99 | -1 | 0,7 | 0,2 | -0,9 | chlororaphine ( grønt phenazinpigment = reduceret og gul = oxideret) | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | |||||
| Pseudomonas | cichorii | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | citronellolis | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | coronafaciens | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | corrugata | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | ficuserectae | uden medicinsk interesse, fytopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | flavescens | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | fragi | uden medicinsk interesse for råddent kød | 0,99 | 0,9 | -0,9 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | fuscovaginae | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | Mandag | ikke medicinsk relevant, psykrotrof isoleret fra kød | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | marginalis | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | meliae | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | mendocina | col pigm brun-gul = intracellulært carotenoid pigment | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | gul-orange ( carotenoid ) | -0,9 | 0,9 | 0,88 | 1 | -1 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | -0,01 | 0,9 | ||||||
| Pseudomonas | mucidolens | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | oleovorans | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | stutzeri | allestedsnærværende | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,88 | -0,21 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,96 | -1 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | 0,7 | 0,21 | 0,96 | |||||
| Pseudomonas | pseudoalcaligenes | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | 0,7 | 0,2 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -1 | -0,9 | ||||||||||
| Pseudomonas | resinovorans | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | savastanoi | uden medicinsk interesse, fytopatogen af oliventræet | 0,99 | 0,9 | 1 | -1 | 1 | -1 | 0,44 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | stanieri | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | rhodesiae | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | jessenii | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | mandelii | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | -0,48 | -0,9 | -0,98 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | gessardii | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | migulai | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | libanensis | i libanesiske kildevand | 0,99 | 0,9 | 0,3 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | cedrella | i libanesiske kildevand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | orientalis | i libanesiske kildevand | 0,99 | 0,9 | -0,9 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | |||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | syringae | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | avellanae | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | taetrolens | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | tolaasii | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | viridiflava | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | aureofaciens | uden medicinsk interesse | 0,99 | -1 | 0,7 | 0,9 | -0,9 | orange = phenazin- 1-carboxylat | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | 0,2 | 0,2 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,2 | 0 | 0,2 | 1 | -0,5 | -1 | -1 | 1 | -1 | 1 | 0,01 | 1 | 0,5 | 0,2 | ||||
| Pseudomonas | sacharophila | uden medicinsk interesse | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | veronii | i mineralvand | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | tomat | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | glycin | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | phaseolicola | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pseudomonas | fluorescens | II | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,6 | -0,9 | 0,3 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,1 | 1 | -1 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
| Pseudomonas | fluorescens | III | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | -0,22 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 1 | -0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
| Pseudomonas | fluorescens | IV | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,9 | -0,89 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 1 | 1 | 1 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
| Pseudomonas | fluorescens | V | 0,99 | -1 | 0,5 | 0,1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,9 | -0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,98 | 1 | 0,1 | 0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,98 | ||
| Pseudomonas | monteilli | 0,99 | -1 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 |
Næsten alle arter har en oxidase (se tabel).
Nedbrydningen af glukose udføres ved ruten Entner-Doudoroff , denne egenskab er demonstreret på Hugh-Leifson-medium . De har ofte en arginindihydrolase, der tillader nedbrydning af arginin i anaerobiose.
Nogle arter kan udvinde det frigjorte ilt ved reduktion af nitrater til nitrogen og dermed vokse anaerobt; dette kaldes derefter " nitratånding ".
Nogle arter eller stammer af pseudomonas producerer acetone (giftig).
Produktion af pigmentMange repræsentanter for denne slægt producerer pigmenter. Disse inkluderer dem, der bruges til identifikation:
- Den pyocyanin , pigment blå - grøn phenazin , opløselig i chloroform og vand er specifik for P. aeruginosa .
- Den pyoverdine , fluorescerende grøn, opløselig i vand, syntetiseres ved Pseudomonas fluorescerende gruppe.
Arter tilhørende slægten Pseudomonas
- Pseudomonas abietaniphila
- Pseudomonas aeruginosa
- Pseudomonas agarici
- Pseudomonas alcaligenes
- Pseudomonas alcaliphila
- Pseudomonas mandel
- Pseudomonas anguilliseptica
- Pseudomonas antarktis
- Pseudomonas argentinensis
- Pseudomonas asplenii
- Pseudomonas aurantiaca
- Pseudomonas avellanae
- Pseudomonas azotifigens
- Pseudomonas azotoformans
- Pseudomonas balearica
- Pseudomonas beijerinckii
- Pseudomonas beteli
- Pseudomonas boreopolis
- Pseudomonas brassicacearum
- Pseudomonas brenneri
- Pseudomonas cannabina
- Pseudomonas carboxydohydrogena
- Pseudomonas caricapapayae
- Pseudomonas cedrina
- Pseudomonas chlororaphis
- Pseudomonas cichorii
- Pseudomonas cissicola
- Pseudomonas citronellolis
- Frosne Pseudomonas
- Pseudomonas corrugata
- Pseudomonas costantinii
- Pseudomonas cremoricolorata
- Pseudomonas extremorientalis
- Pseudomonas ficuserectae
- Pseudomonas flavescens
- Pseudomonas flectens
- Pseudomonas fluorescens
- Pseudomonas fragi
- Pseudomonas frederiksbergensis
- Pseudomonas fulva
- Pseudomonas fuscovaginae
- Pseudomonas gelidicola
- Pseudomonas geniculata
- Pseudomonas gessardii
- Pseudomonas graminis
- Pseudomonas grimontii
- Pseudomonas halodenitrificans
- Pseudomonas halophila
- Pseudomonas hibiscicola
- Pseudomonas indica
- Pseudomonas jessenii
- Pseudomonas jinjuensis
- Pseudomonas kilonensis
- Pseudomonas koreensis
- Pseudomonas libanensis
- Pseudomonas lini
- Pseudomonas lundensis
- Pseudomonas lutea
- Pseudomonas luteola
- Pseudomonas mandelii
- Pseudomonas marginalis
- Pseudomonas mediterranea
- Pseudomonas meliae
- Pseudomonas mendocina
- Pseudomonas mephitica
- Pseudomonas meridiana
- Pseudomonas migulae
- Pseudomonas monteilii
- Pseudomonas mosselii
- Pseudomonas mucidolens
- Pseudomonas multiresinivorans
- Pseudomonas nitroreducens
- Pseudomonas oleovoran
- Pseudomonas orientalis
- Pseudomonas oryzihabitans
- Pseudomonas otitidis
- Pseudomonas pachastrellae
- Pseudomonas palleroniana
- Pseudomonas panacis
- Pseudomonas parafulva
- Pseudomonas pertucinogena
- Pseudomonas pictorum
- Pseudomonas plecoglossicida
- Pseudomonas poae
- Pseudomonas proteolytica
- Pseudomonas pseudoalcaligenes
- Pseudomonas psychrophila
- Pseudomonas psychrotolerans
- Pseudomonas putida
- Pseudomonas resinovorans
- Pseudomonas rhizosphaerae
- Pseudomonas rhodesiae
- Pseudomonas salomonii
- Pseudomonas savastanoi
- Pseudomonas straminea
- Pseudomonas stutzeri
- Pseudomonas synxantha
- Pseudomonas syringae
- Pseudomonas taetrolens
- Pseudomonas thermotolerans
- Pseudomonas thivervalensis
- Pseudomonas tolaasii
- Pseudomonas tremae
- Pseudomonas trivialis
- Pseudomonas umsongensis
- Pseudomonas vancouverensis
- Pseudomonas veronii
- Pseudomonas viridiflava
- Pseudomonas xanthomarina
Liste over arter, der bør udelukkes fra slægten Pseudomonas :
- Pseudomonas beijerinckii
- Pseudomonas beteli
- Pseudomonas boreopolis
- Pseudomonas carboxydohydrogena
- Pseudomonas cissicola
- Pseudomonas flectens
- Pseudomonas geniculata
- Pseudomonas halophila
- Pseudomonas hibiscicola
- Pseudomonas mephitica
- Pseudomonas pictorum
Noter og referencer
- Pitt TL (2002) " Krydsinfektion hos patienter med cystisk fibrose med Pseudomonas aeruginosa ." Thorax 57 (11): 921
- Cluff, MA, Hartsock, A., MacRae, JD, Carter, K., & Mouser, PJ (2014) Temporal ændringer i mikrobiel økologi og geokemi i produceret vand fra hydraulisk brækkede Marcellus Shale gasbrønde . Miljøvidenskab og teknologi, 48 (11), 6508-6517
- Hancock, RE og FS Brinkman (2002) “ Funktion af pseudomonas poriner i optagelse og udstrømning. ” Annu Rev Microbiol 56: 17-38.
- Paradis-Bleau, C. (2003). Fremskyndet udvikling af nye hæmmere mod celledelingsproteinerne FtsZ og FtsA fra Pseudomonas aeruginosa. , speciale i mikrobiologi-immunologi for at opnå graden af kandidatgrad i naturvidenskab (M. Sc.), Université Laval
- Stover, C & al. (2000) "Komplet genom-sekvens af Pseudomonas aeruginosa PA01, et opportunistisk patogen." Natur 406 (6799): 959-64
- Galli, E., S. Silver, B. Witholt & Federation of European Microbiological Societies (1992) Pseudomonas: molekylærbiologi og bioteknologi. Washington, DC, American Society for Microbiology.
- Salyers, AA og DD Whitt (2002) Bacterial patogenese: en molekylær metode . Washington, DC, ASM Press
- LM Baryshnikova, VG Grishchenkov, MU Arinbasarov, AN Shkidchenko og LM Boronin, Biodegradation of Oil Products by Individual Degrading Stammer and Their Associations in Liquid Media , Applied Biochemistry and Microbiology Volume 37, Number 5, 463-468, DOI: 10.1023 / A : 1010285705353
- " Meddelelser om fag, der markedsføres og klassificeres efter producent " , på EuroPhages (adgang 14. april 2018 )
- " Phages-Sans-Frontières - Sammen kan vi prøve at ændre skæbnen!" » , På phages-sans-frontieres.com (adgang til 14. april 2018 )
- " Association PHAG ESPOIRS " , om Association PHAG ESPOIRS (adgang 14. april 2018 )
- Kekacs, D., Drollette, BD, Brooker, M., Plata, DL, & Mouser, PJ (2015). Aerob bionedbrydning af organiske forbindelser i hydrauliske fraktureringsvæsker . Biologisk nedbrydning, 26 (4), 271-287. ( resume ).
Se også
eksterne links
- (fr) " LPSN " ( Arkiv • Wikiwix • Archive.is • Google • Hvad skal jeg gøre? )
- (fr) " Afhandling " ( Arkiv • Wikiwix • Archive.is • Google • Hvad skal jeg gøre? ) Funktionel mangfoldighed af Pseudomonas, der producerer antibiotika i nåletræsosfærer i planteskoler og i naturlige omgivelser, af Mathieu Allaire,Maj 2005.
- (da) “ http://www.genome.jp/kegg-bin/KEGG_Genome_map_top.pl?org_id=pae ” ( Arkiv • Wikiwix • Archive.is • Google • Hvad skal man gøre? ) Genom af Pseudomonas aeruginosa PAO1 (peg på den grå bjælke)]