Inden for civilingeniør er en kapillærbarriere en barriere, der findes mellem to rum, der forhindrer vandets passage ved simpel kapillaritet . Den består af to overlejrede lag af porøst materiale , hvor porerne i det øverste lag er finere end det nederste lag. Når en kapillær barriere underkastes vand infiltration , vil det øvre lag har tendens til at akkumulere vand, så det ikke siver ned i det nedre lag, ifølge teorien af vand strømmer i umættede medier. .
I biologi anvendes kapillærbarrieren (eller alveolær-kapillærbarrieren) til gasoverførsler mellem blodet og lungealveolerne.