Liste over DNA-typer

Afhængigt af deres funktion, deres placering, de kemiske ændringer, de har gennemgået eller brugen af ​​dem i laboratorier, er bestemte navne tildelt visse DNA'er, hvoraf her er en ikke-udtømmende liste:

• Antisense-DNA: komplementær streng (dermed anti ) af det betragtede locus . For eksempel i tilfælde af et gen er dette den ikke-transkriberede streng.
• DNA-lån gapped (i (in) gapped DNA ): DNA dobbeltstrenget molekyle med en eller flere enkeltstrengede regioner.
• Biotinyleret DNA: DNA-molekyle mærket med biotin ved inkorporering af et biotinyleret nukleotid (normalt uracil) i DNA-molekylet. Påvisningen af ​​det mærkede DNA udføres ved dannelsen af ​​et kompleks med streptavidin, hvortil der er bundet et farvestof, såsom peroxidase, der giver en fluorescerende grøn farve som et resultat af en reaktion med forskellige organiske reagenser.
• Kimærisk DNA , rekombinant DNA eller DNA- rekombinant  : DNA bestående af fragmenter af forskellig oprindelse.
• Cirkulært DNA  : et cirkulært DNA- molekyle, derfor uden en fri ende.
• Kovalent lukket cirkulært DNA eller ccDNA (kovalent lukket cirkulært DNA): DNA-molekyle, hvis frie ender er ligeret til dannelse af en cirkel. Trådene forbliver bundet sammen, selv efter denaturering. Plasmider forekommer i denne form in vivo. I sin oprindelige form vil ccDNA tilpasse sig en supercoiled konfiguration.
• Chloroplast-DNA  : DNA fundet i chloroplast . Selvom kloroplasten har et lille genom, indebærer det store antal kloroplaster pr. Celle en betydelig andel af kloroplast-DNA sammenlignet med det samlede DNA i en plantecelle.
• Komplementært DNA eller cDNA  : enkeltstrenget DNA, som er en kopi af et RNA opnået ved omvendt transkription. Dobbeltstrenget cDNA er resultatet af kopiering af den første streng ved hjælp af DNA-polymerase.
• Dobbeltstrenget komplementært DNA eller cDNA  : et dobbeltstrenget DNA-molekyle produceret fra et cDNA-skabelon.
• Denatureret DNA: Dobbeltstrenget DNA, der er omdannet til enkeltstrenget ved at bryde hydrogenbindingerne mellem par af komplementære nukleotider. Ofte reversibel. Normalt opnås ved varme.
• Dobbeltstrenget DNA eller duplex-DNA eller dsDNA  : to komplementære DNA-tråde sammenføjet i form af en dobbelt helix.
• Selvisk DNA (i (i) egoistisk DNA ) af genomiske DNA-sekvenser, der er i stand til at replikere og oversætte, men som ikke giver cellen nogen fordel. Vi taler om egoistisk DNA eller genetisk parasit, fordi dets aktivitet kun tjener til at sikre dets egen vedholdenhed gennem generationer.
• DNA-spacer (en (en) spacer-DNA ): sekvens af ikke-transkriberet DNA, der adskiller gener inden for gentagne enheder.
• Fremmed eller eksogent DNA: DNA fra en organisme, der er til stede (eller er beregnet til at blive introduceret) i en anden organisme, det kan eller måske ikke integreres i genomet af denne organisme.
• Heterolog DNA (heteroduplex): dobbeltstrenget DNA dannet ved parring af to tråde af forskellig oprindelse; det præsenterer domæner i sløjfer i de zoner, hvor parring ikke udføres korrekt.
• DNA homoduplex: Et dobbeltstrenget, fuldt komplementært strandet DNA-molekyle.
• Hybrid DNA  : DNA- molekyle sammensat af to tråde med forskellig oprindelse.
• DNA-linker (en (en) linker-DNA ): syntetisk DNA-fragment (fremstillet på en kemisk og ikke-biologisk måde), der bruges til at forbinde to DNA-molekyler; dette bindende DNA (linker) indeholder generelt et spaltningssted for et restriktionsenzym. Udtrykket DNA-binding henviser også til DNA-segmenterne (55 basepar bundet til histoner) placeret mellem to nucleosomale kerner på kromatinfiberen.
• Mitokondrie-DNA eller mtDNA  : DNA fundet i mitokondrier. Hos pattedyr udgør mtDNA mindre end 1% af det samlede DNA, men i planter er mængden variabel. Det koder for rRNA'er, tRNA'er og nogle mitokondrieproteiner, ofte vigtige for cellulær respiration (op til 30 hos dyr).
• Mobilt DNA ( transposon ): transponerbart element eller "jumpergen" eller DNA-transposon; mobil DNA-sekvens, som kan indeholde gener fra bakterier (såsom antibiotikaresistensgener); DNA-fragment, der er i stand til at bevæge sig langs et deoxyribonukleinsyremolekyle. Blandt transposoner er indsættelsessekvenser, fag-DNA'er og kontrolelementer.
• Ikke-gentagne DNA  : DNA-sekvenser til stede i genomet i et lille antal kopier. Dette DNA udviser den forventede genassociationskinetik for unikke sekvenser og er karakteriseret ved en høj Cot-værdi (dobbeltstrenget DNA-koncentration som en funktion af produktet af den samlede DNA-koncentration (Co) gange inkubationstiden (t) under specifikke betingelser) .
• Bære-DNA (i (i) DNA-bærer ): DNA med ukendt sekvens, som tilsættes til det transformerende DNA ( plasmid ), der anvendes i de fysiske overførselsprocedurer for DNA. Dette ekstra DNA øger effektiviteten af ​​transformation ved elektroporation og kemiske metoder. Handlingsmekanismen er ukendt.
• Junk DNA (i (in) Junk DNA ) pjorativt navn givet til ikke-kodende regioner i et genom.
• Ribosomalt DNA: locus, der koder for ribosomalt RNA. Det er generelt et stort og komplekst sted , typisk sammensat af et stort antal gentagelsesenheder adskilt fra hinanden ved hjælp af en intergen spacer. En gentagelsesenhed indeholder en kopi af genet for hvert ribosomalt RNA, der udgør ribosomer , adskilt fra hinanden med et internt transkriberet afstandsstykke. I eukaryote celler er disse sekvenser, der bærer de gener, der er ansvarlige for syntesen af ​​ribosomalt RNA (rRNA), til stede på DNA'et fra nucleolar-organisatorerne (i nucleolus); med undtagelse af 5S rDNA (som er nukleoplasmatisk).
• Satellit-DNA: svarer til blokke af gentagne sekvenser med en længde på 5 til 2.000 bp (bp = basepar) svarende til en samlet størrelse på 100 Kb til ca. 5.000 Kb, placeret hovedsageligt på niveauet af centromererne og ikke transskriberet. Det er DNA fra centromert heterochromatin placeret i alle kromosomer. Deres funktion er at fikse adskillige proteiner fra centromeren, der er involveret i funktionen af ​​organisering og segregering af kromosomer under mitose.
• Enkeltstrenget DNA eller ssDNA (en (en) enkeltstrenget DNA ): DNA- molekyler adskilt fra deres komplementære streng efter dets fravær eller denaturering.
• Kilde-DNA: DNA fra en organisme, der indeholder et målgen, og bruges som udgangsmateriale i et kloningseksperiment.
• Supercoiled DNA eller Supercoiled DNA eller Supercoiled  DNA: DNA med en supercoiled konfiguration.
• T-DNA  : DNA-segment af Ti- eller Ri- plasmidet , der er til stede i patogenerne Agrobacterium tumefaciens og A. rhizogenes , overført til planteceller og indsat i deres DNA og udgør således en del af infektionsprocessen. Vildtype-T-DNA koder for enzymer, der inducerer i planter syntesen af ​​specifikke opiner, der er nødvendige for bakterievækst. I modificerede T-DNA'er erstattes disse gener med et eller flere transgener .
• Triple-strandet DNA: består af en DNA-streng og to tråde af APN ( nukleinpeptidsyre ), som er en form for kunstig nukleinsyre, og som kan mistænkes for at være kilden til DNA eller RNA.

Relaterede artikler

• Deoxyribonukleinsyre
• Liste over RNA-typer