I cytologi er et anammoxosom en bakteriel organelle karakteristisk for anaerobe kemoautotrofe bakterier kaldet anammox såsom Ca. Brocadia anammoxidans , hvoraf de udgør størstedelen af volumenet. Disse særlige bakterier hørende til phylum af Planctomycetes har en diameter på højst 1 um , og realisere oxidation anaerobe den kation ammonium NH 4 + i nitrogen N 2med nitrit anion NO 2 -som elektronacceptor og hydrazin N 2 H 4og hydroxylamin NH 2 OH som formidlere.
Disse forbindelsers toksicitet skyldes utvivlsomt tilstedeværelsen af bestemte fedtsyrer af ladderantype - pentacycloanammoxinsyre - i membranen, der afgrænser anammoxosomet, for at forhindre diffusion af disse toksiske stoffer i cytosolen .
Anammoxosomet indeholder de enzymer, der er involveret i anammox- reaktionerne , men er måske ikke begrænset til denne funktion alene. Den indeholder rørformede strukturer, der ser ud til at holde den i form af en kompakt masse, idet disse rørformede strukturer undertiden er blevet observeret danner organiserede netværk; det kunne være et cytoskelet involveret i delingen af disse bakterier. Det faktum, at nukleoidens DNA ofte er knyttet til denne organel, antyder, at adskillelsen af kromosomer under celledeling direkte kan involvere selve anammoxosomet.