Et depsipeptid er et peptid , hvor en eller flere af amidbindingerne (-CONH-) erstattes af esterbindinger (-COO-).
Depsipeptider bruges almindeligvis i forskning til at undersøge betydningen af hydrogenbindingsnetværk i kinetik og termodynamik ved proteinfoldning . De findes også i naturen som naturlige produkter. Et bemærkelsesværdigt eksempel er L - Lys - D - Ala - D - Lac - motivet, som findes i cellemembranbestanddele af vancomycinresistente bakterier . Den amid- til- ester mutation interrupts sit netværk af hydrogenbindinger med vancomycin, som er nøglen til dets aktivitet.antibiotikum .
Depsipeptid henviser også til romidepsin , som er medlem af den bicykliske peptidklasse af histondeacetylaseinhibitorer, som først blev isoleret som et fermenteringsprodukt af Chromobacterium violaceum af det farmaceutiske firma Fujisawa. Det bruges til behandling af visse kræftformer, hvor det menes at genaktivere latente gener.
Den depsipeptid etamycin , et naturligt produkt nyligt isoleret fra en marin actinomycet demonstrerer aktivitet in vitro og i mus mod MRSA . Det blev observeret at have en positiv rolle i genekspression i 1990. Et klinisk forsøg blev udført i 1996 for T-celle lymfom.