Den fysioterapeut diagnose er den ætiologiske hypotese er vedtaget af fysioterapeut til behandling af sin patient. Med andre ord er det den væsentlige dysfunktion, som fysioterapeuten retter sin behandling mod. Dysfunktionen identificeres af fysioterapeuten på baggrund af oplysninger indhentet fra sygdommens historie , tegn, symptomer , undersøgelser og tests, som fysioterapeuten udfører og anmoder om.