Exon

I generne af eukaryote organismer er exoner segmenterne af en RNA- forløber, der er konserveret i RNA efter splejsning, og som findes i modent RNA i cytoplasmaet . De segmenter af RNA-forløberen, der fjernes under splejsning, kaldes i modsætning til introner . Eksoner findes hovedsageligt i messenger-RNA'er (mRNA'er), der koder for proteiner . Nogle mRNA'er kan lejlighedsvis gennemgå en alternativ splejsningsproces , hvor en eller flere eksoner kan udskæres, eller nogle introner kan bevares i sjældne tilfælde.

Generelt består generne af en række alternerende exoner og introner , der starter og slutter med en exon. For eksempel :

Exon 1 - Intron 1 - Exon 2 - Intron 2 - Exon 3 - ... - Intron n -1 - Exon n

Efter transkription i kernen (i eukaryoter) vil det syntetiserede RNA gennemgå et antal modifikationer, herunder splejsning , hvor eksoner vil blive syet og intronerne udskåret fra RNA for at give l Funktionelt modent RNA, såsom mRNA anvendes til translation til protein efter eksport til cytoplasmaet.

Langt størstedelen af ​​gener i højere eukaryoter indeholder introner; nogle er imidlertid sammensat af kun en exon, for eksempel generne af histoner i akkordater . Kun ca. 3% af humane gener indeholder kun en exon og derfor ingen intron.

Der er også en mere usædvanlig måde at introner i gener på bakterier eller arkæer og i nogle vira, der inficerer. Disse er ofte introner af en speciel type kaldet selvsplejsende introner.

Eksoner og kodende regioner

Det er vigtigt at undgå forveksling mellem begreberne exon / intron og kodning / ikke-kodning. Eksonerne kan under ingen omstændigheder defineres som de kodende dele af udskrifterne.

• For gener, der koder for proteiner, omfatter messenger RNA utranslaterede regioner opstrøms (5 ' UTR ) og nedstrøms ( 3' UTR ) af den kodende sekvens. UTR'er er til stede i modent RNA efter splejsning og er derfor eksoniske, men er pr. Definition ikke-kodende, da de tilsvarende sekvenser er placeret opstrøms for translation- startkodonen eller nedstrøms for stopkodonen, der afslutter den åbne læseramme .
• Flere typer RNA er ikke-kodende ( transfer RNA , ribosomalt RNA , lang RNA ikke-kodning ...), dette forhindrer ikke dem i at blive splejset (og indeholder således introner og exoner).
• På grund af alternativ splejsning kan visse regioner af RNA være enten eksoniske eller introniske afhængigt af væv eller cellulære forhold. Disse fragmenter er potentielt kodende (de kan tjene som en model for syntesen af polypeptidet ), men introniske i visse væv.

Fordeling af exoner

Størrelsen af ​​eksonerne i genomerne følger en lognormal fordeling med en gennemsnitlig længde på ca. 150 nukleotider, som varierer relativt lidt mellem forskellige arter af eukaryoter. Den lognormale karakter af denne fordeling indebærer dog en ret stor variation omkring denne middelværdi. Den største kendte exon er således 17 106 nukleotider lang, er det placeret i det humane gen, der koder giant protein Titin . Det er også genet med det største antal eksoner, ikke mindre end i alt 363.

I det menneskelige genom indeholder gener i gennemsnit ca. 9 exoner og 8 introner. Der er dog også betydelig variation, for eksempel indeholder nogle humane gener kun en exon og ingen intron. Dette er tilfældet med gener, der koder for histoner .

Noter og referencer

1. Donald Voet og Judith G. Voet , Biochimie , Paris, de Boeck,2005, 1600  s. ( ISBN  978-2-8041-4795-2 ) , afsnit 31-4
2. "  Undersøgelse af reguleringen af ​​alternativ splejsning  "
3. Ewa A. Grzybowska , ”  Human intronless gener: funktionelle grupper, associerede sygdomme, evolution og mRNA-behandling i mangel af splejsning  ”, Biochemical and Biophysical Research Communications , vol.  424, nr .  1,20. juli 2012, s.  1–6 ( ISSN  1090-2104 , PMID  22732409 , DOI  10.1016 / j.bbrc.2012.06.092 , læst online , adgang til 13. januar 2017 )
4. F. Martínez-Abarca og N. Toro , "  Gruppe II-introner i bakterieverdenen  ", Molecular Microbiology , bind.  38, nr .  5,1 st december 2000, s.  917–926 ( ISSN  0950-382X , PMID  11123668 , læst online , adgang til 13. januar 2017 )
5. M. Long , C. Rosenberg og W. Gilbert , ”  Intron fase korrelationer og udviklingen af intron / exon-strukturen af gener  ”, Proceedings of National Academy of Sciences i USA , vol.  92, nr .  26,19. december 1995, s.  12495–12499 ( ISSN  0027-8424 , PMID  8618928 , PMCID  40384 , læst online , adgang til 14. januar 2017 )
6. ML Bang , T. CENTNER , F. Fornoff og AJ Geach , ”  Den komplette gensekvens af Titin, ekspression af en usædvanlig ca. 700 kDa Titin isoform, og dens interaktion med obscurin identificere en hidtil ukendt Z-line til I-band linking system  ”, Circulation Research , bind.  89, nr .  11,23. november 2001, s.  1065–1072 ( ISSN  1524-4571 , PMID  11717165 , læst online , adgang 14. januar 2017 )
7. Liucun Zhu , Ying Zhang , Wen Zhang og Sihai Yang , "  Mønstre af exon-intron arkitektur variation af gener i eukaryote genomer  ", BMC Genomics , bind.  10,1 st januar 2009, s.  47 ( ISSN  1471-2164 , PMID  19166620 , PMCID  2636830 , DOI  10.1186 / 1471-2164-10-47 , læst online , adgang til 14. januar 2017 )

Se også

Relaterede artikler

• Splejsning
• Exon springer over
• Brygning af eksoner
• Intron
• Cistron

eksterne links

• Dotplot , online applikation til fremhævning af introner og exoner.