De exoribonucleases er enzymer begge typer exonuklease og ribonuklease , dvs., enzymer, som nedbryder RNA ved fjernelse af terminale nukleotider, eller fra enden 5' eller fra 3'-enden af RNA-molekylet. Enzymer, der skærer nukleotider fra 5'- enden, kaldes 5'-3'-exoribonukleaser, og enzymer, der skærer nukleotider fra 3'- enden, kaldes 3'-5'-exoribonukleaser .
Exoribonukleaserne kan bruges til at adskille internukleotidbindinger enten vand (dette kaldes hydrolytisk aktivitet) eller uorganiske fosfater (kaldet phosphorolytisk aktivitet). Hydrolytiske exoribonukleaser bærer nummeret EC 3.1, og phosphorolytiske exoribonukleaser bærer nummeret EC 2.7.7. Anvendelsen af phosphorolytiske enzymer (som bruger et uorganisk phosphat som en cofaktor) resulterer i frigivelse af nukleotiddisfosfater, mens hydrolytiske enzymer (som bruger vand som en kofaktor) resulterer i frigivelse af nukleotidmonosfosfater.
Exoribonukleaser findes i alle levende kongeriger: bakterier , arkæer og eukaryoter . Exoribonukleaserne er involveret i nedbrydningen af forskellige RNA-arter, såsom messenger-RNA'er , transfer-RNA'er og ribosomale RNA'er .
De kan dannes enten af et enkelt protein (som det er tilfældet for RNase D eller RNase PH ) eller af flere proteiner, der danner proteinkomplekser, såsom exosomer , hvor vi finder fire store familier af exoribonukleaser.
| Familie | Eksempler | Fordeling | Enzymaktivitet |
|---|---|---|---|
| RNR | RNase R | De fleste bakterier, alle eukaryoter | hydrolyse 3'-5 ' |
| RNase II | |||
| Rrp44 | |||
| DEDD | RNase D. | Nogle bakterier, alle eukaryoter | hydrolyse 3'-5 ' |
| RNase T | |||
| PM / Scl-100 | |||
| Oligoribonuklease | |||
| RBN | RNase BN | Nogle bakterier | hydrolyse 3'-5 ' |
| PDX | PNPase | Alle kongeriger | phosphorolyse 3'-5 ' |
| PM / Scl-75 | |||
| RNase PH | |||
| RRP4 | Rrp4 | Alle eukaryoter, mest arkæer | hydrolyse 3'-5 ' |
| 5PX | Exoribonuclease I | Alle eukaryoter | hydrolyse 5'-3 ' |
| Exoribonuclease II |