Liste over RNA-typer

Dette er en liste over forskellige typer RNA, der findes i naturen. Nogle kategorier er meget brede, andre er begrænset til et enkelt RNA .

Forskellige typer RNA

I cellen eller in vitro er der derfor flere typer eller kategorier af RNA:

• GRNA: genomisk RNA ( dobbeltstrenget RNA, der udgør genomet for nogle vira).
• Guide RNA ( RNA guide ): små transkriberede RNA'er på 50 til 70 nukleotider, der fungerer som en RNA-skabelon til DNA-telomerase.
• RNAi: RNA-interferens ( RNA-interferens ); RNA-molekyle, der er i stand til at kontrollere ekspressionen af ​​gener lokaliseret på virale RNA'er (ved binding ved komplementaritet til deres nukleotidsekvens). Dette princip bruges i molekylærbiologi til at hæmme ekspressionen af ​​et gen på en bestemt måde.
• Messenger RNA eller mRNA  : det dannes ved transkription af et DNA-gen, som det er en kopi af. Dens rolle er at transportere den genetiske information indsamlet fra kernen til cytoplasmaet, hvor den vil blive oversat til protein af ribosomerne i det endoplasmatiske retikulum .
• Pre-messenger RNA eller pre-messenger RNA eller pre-mRNA  : RNA-forløber mRNA gennemgår posttranslationsændringer, der fører til produktion af mRNA.
• MRNA: ikke-messenger RNA; det vil sige RNA'er, som ikke oversættes til proteiner.
• Positivt RNA: Viralt RNA med positiv polaritet, som kan oversættes direkte af ribosomerne i den inficerede celle. I tilfælde af virale RNA'er med negativ polaritet transskriberer en viral transkriptase dem til RNA med positiv polaritet, så de kan oversættes til proteiner.
• Overfør RNA eller tRNA  : Disse bruges til at "oversætte" kodonerne af mRNA til aminosyrer. Dette er molekyler, der placeres på de steder i ribosomet, hvor messenger-RNA'et vil blive aflæst. Et tRNA er en kort streng, der har et antikodon på sin sløjfe, og en aminosyre bundet til den anden ende, der vil blive overført til det dannende protein.
• TRNA-aminoacyl: overført RNA (tRNA) ladet, det vil sige et tRNA, der bærer dets aminosyre.
• TmRNA : essentielt for de fleste bakterier, disse RNA'er har en hybridfunktion mellem den af ​​et tRNA og et mRNA. De tjener til at frigive ribosomer, der er blokeret under translationen af ​​utilsigtet trunkerede mRNA'er, ved at styre læsningen på sig selv (mRNA-funktion) og ved at indlæse de manglende ribosomer med efterfølgende kodoner (tRNA-funktion tvunget for at tillade translationel translokation). Den korte peptidsekvens kodet af mRNA-funktionen er fusioneret til det spirende, men ufuldstændige protein og udgør et målsignal for intracellulære proteaser (f.eks. ANDENYALAA i E. coli ). Således frigøres ikke kun ribosomer fra utilsigtet blokering og kan genbruges, men ufuldstændige proteiner og RNA ødelægges og genbruges også.
• Ribosomalt RNA  : det repræsenterer 80% af det totale RNA i en celle. Associeret med proteiner, danner det ribosomet, som udgør læsehovedet for den genetiske information transkriberet af messenger-RNA'et.
• TRNA-isoacceptorer: forskellige overførsels-RNA'er, der er i stand til at bære den samme aminosyre.
• Antisense RNA (aRNA): RNA komplementært til en del af et andet RNA og hæmmer dets funktion. Antisense-RNA'er kan være naturlige regulatoriske elementer (eksempel: MIC-RNA'er). De kan også fås ved genteknologi.
• MIC-RNA  : speciel klasse af antisense-RNA, komplementær til 5'- endenaf et mRNA og hæmmer dets funktion. MIC-RNA'er er naturlige reguleringselementer.
• Monocistronic RNA  : RNA, der kun indeholder en genetisk information. En cistron er en region i genomet, der kun bærer en enkelt genetisk information transkriberet til RNA. Dette udtryk stammer fra brugen af ​​"cis-trans" -testen, der anvendes i klassisk genetik til at fremhæve cistroner i bakterier. For et mRNA svarer en cistron til et enkelt polypeptid.
• Polycistronic RNA  : messenger-RNA indeholdende flere cistroner og koder derfor for flere forskellige polypeptidkæder.
• Stor nuklear RNA eller heterogen  nuklear RNA: nuklear RNA som følge af transkription med polymerase II. Disse RNA'er er heterogene i størrelse og ikke særlig stabile.
• Rekombinant RNA  : RNA- molekyle sammensat af fragmenter af forskellig oprindelse forbundet sammen in vitro af en RNA-ligase.
• Satellit-RNA  : RNA, der kan ledsage nogle vira . Satellit-RNA, pakket, er specifikt for hver virus og kan ikke replikere uden det.
• små nukleare RNA eller snRNA'er  : RNA fra splejsning eller splejsosom maskiner . De er forbundet med proteiner i ribonukleoproteinpartikler kaldet snRNP'er eller undertiden "snurps".
• små nukleolære RNA'er eller snoRNA'er  : guide RNA'er, der deltager i inkorporeringen af ​​kemiske modifikationer i andre RNA'er. De to vigtigste ændringer er methylering af 2'-positionen af ribose og pseudouridylation (omdannelse af uridin til pseudouridin ).
• aptamerer  : kunstige RNA'er valgt "in vitro" for en bestemt egenskab ved ligandbinding eller enzymatisk katalyse.
• NcRNA (RNA n on- c odage; se også "ARNnm" ovenfor). Mest RNA koder ikke for et protein (97% ifølge Mattick). Nogle af disse ncRNA'er har regulerende roller for metaboliske processer (se ovenfor). Meget kan simpelthen være meningsløst, men det kan også tjene andre roller, såsom postuleret kodning af handlingsgenstande ; (se efter):

Forvirring

På trods af navnet er RNA-polymerase ikke RNA, men et enzym, der katalyserer syntesen af ​​RNA fra DNA , på samme måde som DNA-polymerase ikke er DNA, men det enzym, der katalyserer. DNA-syntese fra DNA.

Noter og referencer

1. Mattick, JS, (2003). "Udfordrer dogmen: Det skjulte lag af ikke-proteinkodende RNA'er på komplekse organismer", BioEssays , 25 , 930-939. [1]

Se også

• Ribonukleinsyre
• Ikke-kodende RNA
• Liste over DNA-typer