Eric Westhof

Eric Westhof Biografi
Fødsel 25. juli 1948
Ukel
Nationalitet fransk
Uddannelse universitet i Liège
Aktiviteter Biokemiker , forsker
Andre oplysninger
Arbejdede for University of Strasbourg
Medlem af Académie des sciences
Académie Léopoldine
Academia Europaea (2001)
Priser Charles-Léopold-Mayer-prisen (2007 og 2007)
Ridder af den nationale fortjenstorden (2015)

Éric Westhof er en fransk biokemiker født i Uccle ( Belgien ) den25. juli 1948. Han er medlem af Académie des sciences, delegeret til uddannelse (DEF) og medlem af bestyrelsen for “ La Main à la Pâte  ” Foundation  . Han er professor emeritus i strukturel biokemi ved University of Strasbourg ved Institute of Molecular and Cellular Biology .

Biografi

Efter at have opnået en licens i fysiske videnskaber fra universitetet i Liège , udførte han forskningsarbejde ved Regensburg Universität ( Tyskland ) med tilskud fra EURATOM med henblik på den doktorgrad, han opnåede fra universitetet i Liège i 1974. Han blev derefter forsker Associeret (med et Fullbright-Hays Fellowship) ved University of Wisconsin indtil 1977 i laboratoriet af professor M. Sundaralingam. Takket være et EMBO- tilskud bosatte han sig derefter i 1981 ved Institut for Molekylær og Cellulær Biologi ved National Center for Scientific Research (IBMC-CRNS), tilknyttet University Louis Pasteur (ULP-Strasbourg) i Frankrig. I 1984 fik han en stilling som forsker (CR1) der, og siden 1988 har han været professor i strukturel biokemi . Fra 2005 til 2016 var han direktør for CNRS-forskningsenheden "Architecture and Reactivity of RNA" ved Institute of Molecular and Cellular Biology (IBMC), hvor han var direktør fra 2006 til 2016. Fra 2003 til 2007 er han formand for forskningskommission ved Det Biovidenskabelige Fakultet ved Louis Pasteur University, hvoraf han var valgt som medlem af det Videnskabelige Råd mellem 2002-2006. Han blev derefter valgt til næstformand for forskning og doktorgradstræning (2007-2008). Han deltog sammen med Alain Beretz i fusionen af ​​de tre Strasbourg-universiteter og blev vicepræsident for forskning og doktorgradstræning ved universitetet i Strasbourg mellem 2009 og 2012.

Eric Westhof er administrerende redaktør for RNA Journal (CSHP) , Nucleic Acids Research (OUP) og Journal of Molecular Recognition (Wiley) .

Forskningsarbejde

Hans forskningsfelt vedrører strukturbiologien af nukleinsyrer ( stereokemi , topologi , modellering og bioinformatik ) og især ribonukleinsyremolekyler ( RNA ). Han har udviklet computerværktøjer dedikeret til krystallografiske forbedringer og computermanipulation af nukleinsyrer. Disse har ført til tredimensionelle RNA-strukturer af fremragende kvalitet. I mere end et årti, har disse værktøjer blevet brugt af nukleinsyre- krystallografer i mange lande. På et tidspunkt, hvor kun strukturen for overførsels-RNA var kendt, foreslog han sammen med François Michel en tredimensionel model af hjertets struktur af autokatalytisk gruppe I.- introner . Ti år senere bekræftede krystallografi modelens arkitektur og gav således en stort felt af nye anvendelser inden for strukturbiologi. Foldene af andre ribozymer (hepatitis delta-virus, ribonuklease P, hårnål ribozym ) er også blevet foreslået. Flere år efter disse publikationer har uafhængige krystalstrukturer vist korrektheden af ​​foldene og interaktioner, der er ansvarlige for selvmontering . Hans ekspertise inden for modellering af RNA-strukturer har fået ham til at samarbejde med flere grupper. Sammen med F. Eckstein og T. Tuschl blev den første hammerhead ribozymmodel således produceret baseret på fluorescensdata . Med M. Kochoyan blev de første modeller af RNA-aptamerer modelleret ud fra nukleare magnetiske resonansdata præsenteret. Med W. Filipowicz og F. Kolb er der blevet offentliggjort en model for binding og spaltning af dobbeltstrenget RNA ved DICER, der forklarer modning af microRNA'er .

Analyse af krystallografiske strukturer og sammenligninger med teoretiske modeller gjorde det derefter muligt at etablere forudsigelige regler for RNA-foldning. Med Neocles Leontis foreslog Eric Westhof en ontologi af par mellem baserne af nukleinsyrer, der muliggør automatisk annotering af krystalstrukturer og bioinformatisk søgning af strukturerede regioner i RNA-sekvenser. Dette arbejde med strukturel bioinformatik af RNA har gjort det muligt at identificere et sæt begrænsninger i rækkefølge, der tillader arkitektoniske modeller af RNA. Dette sæt regler og begrænsninger, som kan læses fra sekvensjusteringer og kan manipuleres af en computer, gør det muligt at udlede RNA-arkitekturer, der er vigtige for deres forståelse af funktion og strukturel udvikling af RNA'er.

Éric Westhof har udvidet sine fysisk-kemiske, strukturelle og dynamiske studier af RNA til funktionelle og evolutionære aspekter såvel som til forudsigelse af stærke og specifikke molekylære interaktioner med molekyler af terapeutisk interesse. De krystallografiske strukturer i mange komplekser mellem aminoglycosidantibiotika og A-stedet i 30S-partiklen af ​​eubakterielle ribosomer viser klart oprindelsen af ​​den bindingsspecificitet og resistens, der induceres af disse aminoglycosider . For nylig er der med Marat og Gula Yusupov og deres samarbejdspartnere påvist en god forståelse af afkodningsfejlene på grund af tautomere former for parene mellem G og U. Parallelt med Henri Grosjean rejser en ny repræsentation af den genetiske kode, der er forankret i strukturerne af ribosomer, der er knyttet til messenger-RNA og overførsel af RNA'er, og integrering af de meget talrige observationer om virkningerne af ændringer af transfer-RNA'er.

Andre artikler baseret på analysen af ​​krystallografiske strukturer og bioinformatik genererede et stort antal citater. Med Marc van Regenmortels hold demonstrerede Eric Westhof i 1984 en sammenhæng, der har vist sig at være central inden for immunkemi: epitoperne af antigener har generelt større mobilitet end de mindre immunogene regioner af proteiner. Med Pascal Auffinger blev betydningen og specificiteten af ​​bindinger medieret af et halogenatom i biologiske makromolekyler og nukleinsyrer etableret. Endelig, med Génolevures-konsortiet, kommenterede de ikke-kodende RNA'er fra gær ud over de kodende gener og sammenlignede dem mellem gærene.

Bibliografi

Medlemskab af lærde samfund

Medlemskab af andre akademier

Præmier og anerkendelse

Noter og referencer

  1. "  Eric Westhof  "
  2. "  Videnskabsakademi  "
  3. "  La Main a la Pâte  "
  4. "  IBMC  "
  5. Westhof E, et al., "  Crystallographic Refinement of Yeast Aspartic Transfer RNA,  ", J. Mol. Biol. , (1985), 184, s.  119-145
  6. Michel F, et al., "  Modellering af den tredimensionelle arkitektur af katalytiske introner i gruppe I baseret på komparativ sekvensanalyse,  ", J. Mol. Biol. , (1990), 216, s.  585-610
  7. Tuschl, T., et al., “  En tredimensionel model for hammerhovedribozym baseret på fluorescensmålinger.  », Science , (1994), 266, s.  785-789
  8. Yang, Y., et al., “  Strukturelt grundlag for liganddiskrimination ved to beslægtede RNA-aptamerer løst ved NMR-spektroskopi.  », Science , (1996), 272, s.  1343-1347
  9. Zhang, H., et al., “  Single processing center modeller for human Dicer og bakteriel RNase III.  », Cell , (2004), 118 (1), s.  57-68
  10. Leontis NB, et al., "  RNA geometrisk nomenklatur og klassificering af RNA-basepar  ", RNA , (2001), 7, s.  499-512
  11. Vicens Q, et al., "  Krystalstruktur af paromomycin docket i det eubakterielle ribosomale afkodning A-sted  ", Structure , (2001), 9, s.  647-658
  12. Demeshkina, N., et al., “  En ny forståelse af afkodningsprincippet på ribosomet.  », Nature , (2012), 484 (7393), s.  256-259
  13. Westhof, E., et al., “  Anerkendelse af Watson-Crick basepar: begrænsninger og grænser på grund af geometrisk udvælgelse og tautomerisme.  », F1000Prime Rep , (2014), 6, s.  19
  14. Grosjean, H., et al., “  Et integreret, struktur- og energibaseret billede af den genetiske kode  ”, Nucleic Acids Res , (2016) 44, s.  8020-8040
  15. Westhof E, et al., “  Mondragon A, Klug A, Van Regenmortel MHV, Correlation between Segmental Mobility and the Location of Antigenic Determinants in Proteins  ”, Nature , (1984), 311, s.  123-126
  16. Auffinger, P., et al., ”  Halogen bindinger i biologiske molekyler.  », Nature , (2004), 101 (48), s.  16789-16794
  17. Dujon, B., et al., "  Genome evolution in gær  ", Nature , (2004), 430 (6995), s.  35-44
  18. "  RNA Society  "
  19. "  Hus for videnskab i Alsace  "
  20. "  Leopoldina  "
  21. "  Academia europaea  "

eksterne links