Cytokrom f
C- terminal domæne af cytochrom f
Struktur af det opløselige domæne af cytochrom f af Phormidium laminosum , en cyanobakterie ( PDB 1Cl3 ).
| Pfam | PF01333 |
|---|---|
| Klan Pfam | CL0105 |
| InterPro | IPR002325 |
| PROSITY | PDOC00169 |
| SCOP | 1ctm |
| OVERFAMILIE | 1ctm |
| TCDB | 3.D.3 |
| OPM- familien | 345 |
| OPM protein | 3h1d |
Den cytochrom f ( cyt f ) er den største underenhed af det komplekse cytochrom b 6 f ( EF ), hvor sidstnævnte er funktionelt og strukturelt beslægtet med komplekse cytochrom bc 1 af mitokondrier ; den cytochrom f spiller en rolle i lighed med cytochrom c 1 , selv om de har en anden struktur.
Den tredimensionelle struktur af majroe ( Brassica rapa ) cytochrom f blev bestemt. Lumen- sidesegmentet præsenterer to strukturelle domæner: et mindre på et større placeret på segmentet, der danner forbindelsen til membrandomænet . Det større domæne består af en antiparallel beta-sandwich og et kort hæm- bindende peptid . Det mindre domæne er et beta-ark indsat mellem beta-strengene F og G i det større domæne. Hæm indsættes mellem to små propeller og enden N- terminal af cytochrom f .
Inden i den anden helix, de sekvens Cys - Xaa - Xaa - Cys - Hans ( resterne 21 til 25) indeholder aminosyrer covalent knyttet til hem af thioester binding med cystein-21 og cystein-24 . Histidin-25 er den 5 th liganden af kationen af jern af hæm, den 6. th liganden er den gruppe amin af tyrosin -1 af den første helix.
Cytochrom f indeholder et internt netværk af vandmolekyler, der kan fungere som en protonkanal ; denne struktur synes at være konserveret i de forskellige cytochromer f undersøgt.
Noter og referencer
- (i) Roger C. Prince og Graham N. George , " Cytochrome f Revealed " , Trends in Biochemical Sciences , bind. 20, nr . 6, Juni 1995, s. 217–218 ( læs online ) DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 89018-0
- (i) SE Martinez, D. Huang, Mr. Ponomarev, WA Cramer og JL Smith , " Heme-redox-centret i chloroplastcytokrom f er knyttet til en fembegravet vandkæde ' , Protein Science , bind. 5, n o 6, Juni 1996, s. 1081-1092 ( PMCID 2143431 , læs online ) DOI : 10.1002 / pro.5560050610
- (da) Bendall, DS, " Den ufærdige historie om cytokrom f " , Fotosynt. Res. , Vol. 80, n knogle 1-3,2004, s. 265–276 ( PMID 16328825 , DOI 10.1023 / B: PRES.0000030454.23940.f9 )
- (en) Cramer, WA, Martinez, SE, Huang, D., Tae, GS, Everly, RM, Heymann, JB, Cheng, RH, Baker, TS og Smith, JL, “ Strukturelle aspekter af cytokrom b 6 f- komplekset ; struktur af lumen-side-domænet af cytochrom f ” , J. Bioenerg. Biomembr. , Vol. 26, nr . 1,1994, s. 31–47 ( PMID 8027021 , DOI 10.1007 / BF00763218 )