Eco RI (Eco "R" un) er et restriktionsenzym produceret af bakteriestammen Escherichia coli , enkommensal bakterie i det menneskelige fordøjelsessystem . Dens genkendelsessted er som følger:
5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'For det meste er restriktionsstederne palindromiske , dvs. DNA-sekvensen er den samme, når den læses fra 5 'til 3' -retningen.
Det er en type II restriktionsendonuklease , som er meget almindelig hos bakterier.
EcoRI bevæger sig ved at glide langs fosfat-sukker-rygraden i DNA. EcoRI kan binde sig til DNA på to måder: på en måde, der er specifik for dets genkendelsessted, immobil, hvilket fører til DNA-spaltning og på en løsere og ikke-specifik måde, der tillader dets forskydning. Disse 2 måder anvendes skiftevis og kontinuerligt.
Skæringen i DNA vil blive forskudt på hver streng af et par nukleotider. Udskæringen siges at danne sammenhængende ender (i modsætning til stumpe ender, hvor der ikke er nogen forskydning i snittet, opnået ved EcoRV, et andet restriktionsenzym).