Lokiarchaeota

Lokiarchaeota Klassifikation
Reger Archaea

Afdeling

Lokiarchaeota
Spang et al. 2015

Fylogenetisk klassificering

Position:

Lokiarchaeota er en filum af Archaea defineret i 2015.

Beskrivelse

Efter at være blevet opdaget ved metagenomiske analyser , kendes dets morfologiske egenskaber ikke. Den nomenklatur af denne taxon blev officielt indført i 2015, efter identifikation af et genom behandlede Kandidat under metagenomisk analyse af en prøve af sedimenter fra havbunden .

Sedimentet prøve blev opnået i nærheden af en hydrotermisk udluftning i en uddannelse klippe kendt som Castle of Loke ( Loke Slot på engelsk) på Gakkel Ridge i Polarhavet .

Betydningen af phylum Lokiarchaeota skyldes, at fylogenetisk analyse viser, at der foreligger en monofyletisk gruppe bestående af lokiarchaeotes og eukaryoter , samt tilstedeværelsen af flere gener med funktioner i forbindelse med den cellemembranen . Det gør det muligt at bringe en sten til bygningen af ​​viden om eukaryoternes oprindelse, en af ​​hypoteserne, der foreslår, at den fælles forfader til eukaryoter er tæt på Archaea.

Referencer

  1. (da) Anja Spang , Jimmy H. Saw , Steffen L. Jørgensen , Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka , Joran Martijn , Anders E. Lind , Roel van Eijk , Christa Schleper , Lionel Guy og Thijs JG Ettema , “  Complex archaea der bro over kløften mellem prokaryoter og eukaryoter  ” , Nature ,2015( ISSN  0028-0836 , DOI  10.1038 / nature14447 , læs online [PDF] )
  2. (en) Steffen Leth Jørgensen , Bjarte Hannisdal Anders Lanzen , Tamara Baumberger , Kristin Flesland , Rita Fonseca , Lise Øvreås , Ida H Steen , Ingunn H Thorseth , Rolf B Pedersen og Christa Schleper , "  korrelerer mikrobielle samfundsprofiler med geokemiske data i højt lagdelte sedimenter fra Arctic Mid-Ocean Ridge  ” , PNAS , vol.  109, nr .  42,5. september 2012, E2846 - E2855 ( DOI  10.1073 / pnas.1207574109 , læs online )
  3. (i) Steffen Leth Jørgensen , H Ingunn Thorseth Rolf B Pedersen , Tamara Baumberger og Christa Schleper , "  Quantitative og fylogenetisk undersøgelse af Deep Sea Archaeal Group i sedimenter i det arktiske Oceanryg spreder  " , Frontiers in Microbiology ,4. oktober 2013( DOI  10.3389 / fmicb.2013.00299 , læs online )
  4. Fabien Goubet, "  Loki, en gammel fætter fra havbunden  " , på Le Temps ,7. maj 2015(adgang til 22. juli 2015 )
  5. "  En ny organisation af levende ting  " , om Le Temps ,7. maj 2015(adgang til 22. juli 2015 )
  6. (i) Paul Rincon , "  Nyligt fundet mikrobe er nær slægtning af komplekse liv  " , på BBC News ,6. maj 2015(adgang til 9. maj 2015 )
  7. (i) Carl Zimmer , "  Under the Sea, en Missing Link i udviklingen af komplekse celler  " på New York Times ,6. maj 2015(adgang til 8. maj 2015 )
  8. (i) S. Kelly , B. Wickstead og K. Gull , "  Archaeal Phylogenomics Giver tegn på en bærer i methanogen Archaea og oprindelsen af oprindelsen har thaumarchaeal for eukaryoter  " , Proceedings of the Royal Society B , vol.  278,2011, s.  1009–1018 ( DOI  10.1098 / rspb.2010.1427 , læst online , adgang til 5. oktober 2012 )
  9. (i) John M. Archibald , "  Eocyt-hypotesen og oprindelsen af ​​eukaryote celler  " , PNAS , bind.  105, nr .  51,23. december 2008, s.  20049-20050 ( DOI  10.1073 / pnas.0811118106 , læst online , adgang til 5. oktober 2012 )
  10. , (in) Anthony M. Poole og Nadja Neumann , "  Reconciling year archaeal origin of eukaryotes with engulfment: a biologically plausible hypothesis update of the Eocyte  " , Research in Microbiology , Vol.  162,2011, s.  71–76 ( DOI  10.1016 / j.resmic.2010.10.002 , læst online , adgang til 5. oktober 2012 )
  11. (i) Lionel Guy Thijs JG Ettema , "  The archaeorganisme 'TACK' superphylum og oprindelsen af eukaryoter  " , Trends in Microbiology , Vol.  19, nr .  12,december 2011, s.  580–587 ( PMID  22018741 , DOI  10.1016 / j.tim.2011.09.002 , læst online , adgang til 5. oktober 2012 )
  12. (i) Cymon J. Cox , Peter G. Foster , Robert P. Hirt , Simon R. Harris og T. Martin Embley , "  The Origin af eukaryote ARCHAebacterial  " , PNAS , bind.  1105,23. december 2008, s.  20356–20361 ( DOI  10.1073 / pnas.0810647105 , læst online , adgang til 5. oktober 2012 )