Den rige (fra latin ” Regnum ”, i flertal ” regna ”) er, i taksonomi af Carl von Linné (som klassificerer biodiversitet efter delte fælles karakteristika), det højeste niveau af klassifikationen af levende væsener . I de seneste klassifikationer er regeringstid kun det andet klassifikationsniveau efter domænet eller imperiet .
Hvert kongerige er opdelt i grene (eller undertiden divisioner i botanik ), som også kaldes phylum på latin som på engelsk. De vigtigste niveauer af taksonomisk klassificering er den levende verden, imperium eller domæne, kongerige, fylum eller division , klasse , orden , familie , slægt og art .
En kontroversiel revision af klassificeringen blev foreslået af Carl Woese i 1990 efter at have observeret, hvad der syntes at være store forskelle på molekylært niveau i bakterier og arkæer , skønt begge grupper er sammensat af prokaryote organismer . Woese satte sig derefter for at etablere et klassificeringssystem med tre domæner: bakterier, arkæer og eukaryoter (dette tredje domæne bestående af planter, dyr, protister og svampe). Den nuværende brug af syv-rige systemet er et kompromis mellem det klassiske fem-rige system af Robert Harding Whittaker og Woese's tre-domænesystem. Dette syv-rige system, hvor prokaryoter er opdelt i bakterier og arkæer, er blevet standard i mange værker.
Den traditionelle klassificering af Linné (1735) i to grupper (vegetabilsk / dyr) har udviklet sig til dannelsen af de seks kongeriger i livet ifølge biologi :
I henhold til klassificeringen i seks kongeriger ( Carl Woese , 1977) tages der i betragtning på baggrund af analysen af ribosomale RNA-sekvenser (16S eller 18S) forslaget om at opdele den levende verden i tre " primære kongeriger ", de af arkæebakterier , eubakterier og eukaryoter.
Under organismenes cellulære udvikling har der været et grundlæggende brud, der adskiller gruppen af eukaryoter og prokaryoter .
Prokaryoter ( Procaryota ) er encellede, men kan være flercellede (eksempel: Trichodesmium , en slægt af filamentøse cyanobakterier ), og deres genetiske materiale er ikke lukket i en kerne. De har enzymer placeret i cellevæggen og formerer sig ved fissiparitet . De udgør de første to kongeriger.
Alle andre organismer kaldes "eukaryoter" ( Eukaryota ). Deres genetiske materiale er lukket i en kerne; de har cellulære organeller, cellemultiplikation finder sted ved mitose, og de udviser ofte seksuel reproduktion .
Eukaryoter kan være encellede eller flercellede. Enkeltcellede eukaryoter kaldes "protister" og udgør det tredje rige.
Endelig er flercellede eukaryoter opdelt i tre kongeriger, drømme (svampe), metafytter (klorofylplante) og metazoans (flercellede dyr).
Sondringen mellem riger dyr og planter dannet ud fra den antikke græske, men det var først i midten af XVIII th århundrede, at den formelle anerkendelse af disse to riger har optrådt i nomenklaturen for pennen Linné .
I antikken var de græske filosoffer interesserede i klassificeringen af naturen . De skelnede mellem livløse væsener, mineraler, "animerede væsener" ( zên ), det vil sige udstyret med liv . Blandt disse adskiller de de simpelthen levende, nemlig planter ( zôn ), fra animere ( zôon ). Den Zoia var et koncept, der omfattede hele det ikke-vegetabilske "levende væsener", det vil sige de dyrearter, manden inkluderet, og guderne. Disse tre naturlige klasser, dyr, mennesker og gud blev omtalt som fauner.
Aristoteles (384-322 f.Kr.) var en af de første, der interesserede sig for dyreklassificering. Vi skylder ham grupperingen af dyr med lignende karakterer inden for en slægt, et udtryk, der havde en bredere betydning end det udtryk, der anvendes i dag i biologi , såvel som forskellen mellem forskellige arter inden for samme slægt. Aristoteles delte dyr i to typer: dyr med blod og dem uden blod , i det mindste ikke i besiddelse af rødt blod. Denne skelnen passer ganske godt med vores skelnen mellem hvirveldyr og hvirvelløse dyr . Dyr, der besidder blod, svarende til hvirveldyr, er grupperet i fire slægter: vivipare firfødder ( pattedyr ), fugle , ovipare firfædre ( krybdyr og padder ), Fiskene (inklusive hvaler, fordi Aristoteles ikke var klar over, at de var pattedyr). Blodfrie dyr blev klassificeret som blæksprutter , krebsdyr , insekter (inklusive spindlere ), afskallede dyr (de fleste bløddyr og pighuder ) og plantedyr ( svampe og coelenterater ).
Hvad der blev gjort af Aristoteles for dyreriget, blev også gjort for vegetariket af Theophrastus . Theophrastus opdeler planter i fire grupper efter deres form: træer , buske , underbuske og urteagtige planter . Hos III th århundrede f.Kr.. AD , Theophrastus lavede en liste over omkring 500 arter i sine to hovedværker: Historia plantarum ("Plantehistorien") og " Årsagerne til planter "). Selvom han primært var interesseret i planter af medicinske årsager, blev han ført til at kategorisere dem efter deres reproduktionsmidler.
I det jeg st århundrede e.Kr., Dioscorides beskrevet i hans Materia Medica mere end 600 forskellige planter. Denne bog blev "redigeret" i næsten tusind år.
I det XVIII th århundrede, Carl von Linné , populariseret binomiale system af nomenklatur, der refererer til en art af sit generiske navn (slægt), og dens specifikke tilnavn (arter). Et sammenligneligt binomialt system var oprettet to århundreder tidligere af den schweiziske naturforsker Gaspard Bauhin, som Linné hyldede ved at dedikere artsnavnet Bauhinia bijuga til ham . Linnés ambition var at navngive og beskrive alle de dyr, planter og mineraler, der var kendt i hans tid, ved hjælp af en taksonomisk sætning på et dusin ord. Begrebet hersker på Linnés tid adskiller sig faktisk ikke fra det, der har domineret siden antikken. Det var altid mere en naturalistisk beskrivelse end en biologisk beskrivelse , og derfor finder vi stadig mineralriget der er så kær for alkymister .
Usikker grænse mellem planter og dyrAntikken og middelalderen var naturforskernes æra . De græske filosoffer betragtede naturen som et kontinuum mellem det inerte, det levende og det åndelige. De betragtede koraller som mellemliggende organismer mellem mineralet og de levende, ligesom organismer som svampe og coelenterates i deres øjne er mellemled mellem planten og dyret. Denne monistiske, men bipolære plantekunst-opfattelse vil stadig vare ved Linné, der i 1767 betragtede det ”kaotiske rige” ( Regnum chaoticum ) for at klassificere dyreplanter . Treviranus , i XIX E århundrede, vil navngive dem " zoophytes " og vil klassificere dem i Amphorganicums regeringstid ved siden af kongeriger af planter og dyr. Treviranus Amphorganicums regeringstid indeholdt zoofytter såvel som svampe , bryophytter , bregner , Confervae (filamentøse alger), fuci og Najadales . I 1824 skabte Bory de Saint-Vincent psykodierne (for zoofytter, vorticellider og diatomer ).
I midten af XIX E århundrede blev det anerkendt, at visse organismer, såsom euglena , ikke kunne klassificeres som dyr eller lignende planter. En tredje regeringstid blev nødvendig for at klassificere dem: protisterne .
En verden af levende vil forblive opdelt i dyre- og planteriget indtil begyndelsen af XIX th århundrede . De første observationer af mikroskopiske organismer takket være opfindelsen af mikroskopi ( Leeuwenhoek , 1683) nødvendiggjorde klassificering af dem i den levende verden. De encellede eukaryoter blev derefter klassificeret i dyreriget som protozoer af Owen (1859). De bakterier blev først forbundet med den systematiske enhed af Linnés Verms . Les Vermes , der betyder orme, samlede alle ikke- leddyr hvirvelløse dyr , dette kom sammen skyldtes stangformen og flagellar mobilitet af basillerne . I 1838 klassificerede Ehrenberg , som var den første til at navngive dem bakterier, dem som vibrioer i dyreriget. Men Cohn ændret deres regel i 1872 at klassificere dem blandt planter efter at have vist, at blå-grønne alger er tæt på bakterier. Cohn klassificerede dem som ringere planter i phylum Schizophytes.
For at undgå en vilkårlig fordeling af encellede organismer i det ene eller det andet kongerige har nogle forfattere ( J. Hogg , R. Owen, TB Wilson , J. Cassin og Ernst Haeckel ) foreslået at klassificere lavere organismer i en tredje regeringstid. Haeckel foreslog i 1866 at klassificere disse organismer under protistenes regeringstid . I 1866-versionen samlede protister også svampe. Haeckel reviderede sit system i 1894. Protister var nu lavere, encellede, ikke-vævsdannende organismer. Bakterier var en undergruppe af monerne. De bakterier og Cyanophyta blev rangeret blandt de lavere protister mens protozoer , encellede alger, encellede svampe og skimmelsvampe blev klassificeret som højere protister. I en endelig version i 1904, Haeckel reduceret hans system til to riger: Protista for ikke vævs- danner organismer og Histonia for organismer med væv.
Walton skabte i 1930 det unikke rige Bionta for at navngive alle levende ting. Denne taxon blev opdelt i tre underkongeriger : Protistodeae , Metaphytodeae (multicellular planter) og Zoodeae (multicellular animals).
I 1937 foreslog Édouard Chatton en klassificering af den levende verden i to celletyper, som han kaldte prokaryoter (organismer med celler uden en kerne) og eukaryoter (organismer med celler med en kerne). Begrebet prokaryoter dækker derefter begrebet lavere protister.
I 1939 foreslog Conard at opdele levende organismer i tre kongeriger, Phytalia , Animalia og Mycetalia til planter, dyr og svampe.
I revisionen af sit naturlige system, i 1894, fulgte Haeckel en tredeling og samlede levende organismer i fire kongeriger: I. Protophyta , II. Metaphyta , III. Protozoa , IV. Metazoa .
I 1948 Rothmaler bruges udtrykkene Anucleobionta , Protobionta , Cormobionta , Gastrobionta at definere de fire riger.
I 1956 udgav Copeland sit arbejde med titlen Klassifikationen af lavere organismer . Han beder derefter om fire kongeriger: Mychota (blågrønne alger og bakterier), protoktister (eukaryote alger, svampe, skimmelsvampe og protozoer), planter ( embryofytter og grønalger) og dyr (inklusive svampe).
I 1959 udviklede Whittaker et klassificeringssystem for organismer, der består af fire kongeriger: Protista , Plantae , Fungi og Animalia . Protistriget opdeles derefter i to underkongeriger , Monera til bakterier og blågrønne alger og Eunucleata til encellede organismer med en kernemembran .
Leedale i 1974 foreslog en multipel klassificering af levende ting og foretrak "pteropod" -ordningen baseret på fire kongeriger: Monera , Plantae , Fungi og Animalia .
I 1939 omgrupperede Barkley vira i et bestemt kongerige, så han etablerede et system med levende natur i fem kongeriger: svampe, monera, protister, planter og dyr.
I 1969 foreslog Whittaker en nomenklatur med fem kongeriger: monerer (prokaryoter), protister (encellede eukaryoter), planter (fotosyntetiske multicellulære eukaryoter), svampe (svampe) (ikke-fotosyntetiske multicellulære eukaryoter) og dyr (multicellulære eukaryoter) heterotrofer ). Det fremhæver også tre niveauer af cellulær organisering: prokaryote, unicellular eukaryote og multicellular eukaryote. Hvert af disse niveauer adskiller sig i sin ernæringsmetode. Monera-planter-aksen har en fotosyntetisk ernæringsmetode , monera-fungi-aksen en ernæringsmetode ved absorption, og den protistiske dyreakse er en måde at ernære sig ved indtagelse, hvor indtagelse ikke findes i moneraen.
I 1971 vedtog Margulis den taksonomiske klassifikation af levende ting med fem kongeriger.
Jeffrey i 1982 foreslog en klassificering med to super riger udviklet sig til fem kongeriger, med to riger Bacteriobiota og Archeobacteriobiota i super rige Prokaryota (prokaryoter) og tre riger Phytobiota , Mycobiota og Zoobiota (for planter, svampe og dyr) i Eukaryota ( eukaryotisk) superriget .
Ved slutningen af det XX th århundrede det fylogenetiske klassifikation baseret på den cladisme tager mere forrang traditionelle klassifikationer baseret på valg betragtes som mere subjektive (kriterier morfologiske sammenligning, anatomiske, økologiske eller adfærdsmæssige). Den fylogenetiske tilgang får os til at betragte dem som de ældste adskillelser mellem bakterier , arkæer og eukaryoter .
I 1977 foreslog Woese at anerkende regeringstid for arkabakterier som et resultat af hans undersøgelser af ribosomalt RNA . Derefter syntes fylogenetiske analyser at vise, at arkabakterier er kladistisk tættere på eukaryoter end eubakterier. Woese omdøbte dem derefter til archaea og bakterier for på den ene side at understrege, at der er betydelige molekylære forskelle mellem archaea og eubacteria og på den anden side at bryde med ideen om en organisationsplan, der er fælles for alle prokaryoter., Svarende til den brede følelse af udtryk "bakterier". I dette system med tre domæner foreslog Woese i 1990 to nye regeringer blandt arkæerne : Crenarchaeota og Euryarchaeota, hvortil Korarchaeota senere skulle tilføjes . I bakterier foreslår han at hæve Phyla til rang af rige. I eukaryoter antager Woese, at kongeriget af dyr, planter og svampe kan bevares. Med hensyn til protisterne, der ikke udgør en monofyletisk gruppe, forudser Woese deres opdeling i flere kongeriger.
Mange klassificeringsforslag er kommet frem i litteraturen, men de fleste har ikke fanget det videnskabelige samfunds opmærksomhed . Dette er tilfældet med Jahn og Jahn i 1949, der tilføjede to nye kongeriger, svampe og archetista ( vira ) til det allerede eksisterende firerige system, nemlig metazoa (dyr), metafytter (planter), protisterne og monerer ( prokaryoter ). Den avantgarde idé om at foreslå et nyt kongerige til svampe vil blive taget op tyve år senere af Whittaker i en fem-rige klassifikation (se ovenfor).
Den evolutionistiske Grant udtænkte i 1963 et diagram med seks kongeriger: dyr, planter, svampe (for tyktflydende skimmelsvampe og flere grupper af ægte svampe), protister (kerneholdige encellede organismer), monerer (for bakterier, blå alger) grønne og vira) plus en hypotetisk regeringstid af simple præ-cellulære organismer.
Selvom det er attraktivt, har vira-regeringen endnu ikke haft et stort lydkort. Eksistensen af Mimivirus genoptager dog debatten. Den mimivirus har særegenhed at have syv gener fælles for archaea, bakterier og eukaryoter. Derfor bliver det muligt at oprette et fylogenetisk træ af levende væsener inklusive Mimivirus og derfor potentielt alle vira. Den mimivirus vises på dendrogrammer på en fjerde gren tæt på oprindelsen af eukaryoter og distinkte bakterier, archaea og eukaryoter. Dette antyder en meget stor anciennitet. Genomet blev ikke bygget over forskellige lån, men er faktisk en struktur, der har været homogen under evolutionen. Man kan forestille sig, at de første DNA-vira var degenererede celler svarende til meget gamle linier, som nu er forsvundet med eller ikke forud for LUCA , den sidste universelle fælles forfader.
Det eneste system med seks regeringer, der i øjeblikket får opmærksomhed, er Cavalier-Smith . Dette system blev oprindeligt udgivet i 1998 og har været stort set stabilt gennem regelmæssige opdateringer. Det er et system af to imperier (prokaryoter og eukaryoter) opdelt i seks kongeriger: bakterieriget i prokaryoternes imperium og kongeriget protozoer , kromister , dyr, planter og svampe i eukaryoternes imperium. Archaea i Cavalier-Smith udgør en gren inden for unibakteriernes underrig . Eubakteriernes singularitet sammenlignet med arkabakterier og eukaryoter er ikke desto mindre stadig anerkendt, da Cavalier-Smith adskiller dem ved at gruppere de to sidstnævnte sammen i Neomurans-kladen . Denne klasse Eubacteria og denne Neomura- klade anerkendes dog ikke som taxa, det vil sige at de ikke formelt hører til den foreslåede klassifikation.
I 2015 biologer Ruggiero et al. , inklusive Cavalier-Smith, udvikler en klassifikation af levende organismer underinddelt i to superkongeriger ( Prokaryota og Eukaryota ) og syv kongeriger. Deres mønster, eksklusive vira, inkluderer to prokaryote kongeriger, Archaea ( Archaebacteria ) og Bacteria ( Eubacteria ), og fem eukaryote riger, Protozoa , Chromista , Fungi , Plantae og Animalia .
|
Linné 1735 2 regerer |
Haeckel 1866 3 regerer |
Chatton 1925 2 imperier |
Copeland 1938 4 regerer |
Whittaker 1969 5 regerer |
Woese et al. 1977 6 regerer |
Woese et al. 1990 3 domæner |
Cavalier-Smith 1993 2 imperier og 8 regeringer |
Cavalier-Smith 1998 2 imperier og 6 regeringer |
Ruggiero et al. 2015 2 imperier og 7 regeringer |
|||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (ubehandlet) | Protista | Prokaryota | Monera | Monera | Eubakterier | Bakterie |
P r o k a r y o t a |
Eubakterier |
P r o k a r y o t a |
Bakterie |
P r o k a r y o t a |
Bakterie |
| Arkæebakterier | Archaea | Arkæebakterier | Archaea | |||||||||
| Eukaryota | Protoctista | Protista | Protista | Eucarya |
E u k a r y o t a |
Archezoa |
E u k a r y o t a |
Protozoer |
E u k a r y o t a |
Protozoer | ||
| Protozoer | ||||||||||||
| Chromista | Chromista | |||||||||||
| Vegetabilia | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | Chromista | |||||||
| Plantae | Plantae | Plantae | ||||||||||
| Svampe | Svampe | Svampe | Svampe | Svampe | ||||||||
| Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | |||||
De taksonomiske rækker, der anvendes systematisk til den hierarkiske klassificering af den levende verden, er som følger (i faldende rækkefølge):