National Center for Biotechnology Information

National Center for Biotechnology Information NCBI-logoet fremkalder DNA- dobbelthelixen . Billede i infobox. Historie
Fundament 4. november 1988
Ramme
Forkortelse (en)  NCBI
Type Forskningsinstitut , biologisk database , databibliotek
Sæde Bethesda
Land  Forenede Stater
Kontakt information 38 ° 59 '45' N, 77 ° 05 '56' V
Organisation
Forældreorganisation United States National Library of Medicine
Internet side (da)  www.ncbi.nlm.nih.gov

Det Nationale Center for Biotechnology Information ( NCBI ), på fransk "  amerikanske Center for Biotechnology Information  ", er en amerikansk statsborger institut for molekylær biologisk information .

Denne organisation, der blev grundlagt i 1988 og ligger i Bethesda i Maryland , er en del af US Library of Medicine , et af de amerikanske institutter for sundhed .

Missioner

NCBI forsker i beregningsbiologi, udvikler software til at analysere genomdata og give biomedicinsk information.

NCBI er ikke en database, men den udvikler også offentlige databaser såsom:

Det er på en måde den amerikanske modstykke til European Institute of Bioinformatics (EBI).

NCBI tilbud og indeholder en NCBI taksonomi database , som kun er vejledende. NCBI's websted specificerer, at denne database ikke er en pålidelig kilde til nomenklatur eller klassificering, og at man bør konsultere den relevante videnskabelige litteratur for at få den mest pålidelige information. NCBI-taksonomien repræsenterer ca. 10% af de levende arter på planeten. Denne taksonomi er en kurateret klassificering og foreslås som en organiseret nomenklatur for sekvenser af organismer i offentlige databaser. TaxID (unik identifikator i NCBI-taksonomien) fungerer som et link mellem de tre databaser i International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, "International Collaboration in Nucleotide Sequence Databases "), som Japans DNA-databank er medlem af. ( DDBJ), NCBI (USA) og Det Europæiske Institut for Bioinformatik (EMBL-EBI, Europa).

Noter og referencer

  1. (in) "  Ansvarsfraskrivelse: NCBI-taksonomidatabasen er ikke en autoritativ kilde til nomenklatur eller klassificering - se den relevante videnskabelige litteratur for at få den mest pålidelige information.  » (Se sidefod på dette forskningseksempel .)
  2. "  Hjem - taksonomi - NCBI  " , på www.ncbi.nlm.nih.gov (adgang 30. august 2017 )
  3. (i) Scott Federhen Karen Clark , Tanya Barrett og Helen Parkinson , "  Toward rigere metadata for mikrobielle sekvenser: Udskiftning stamme niveau NCBI taksonomi taxids med Bioproject, bioprøve optegnelser og Assembly  " , Standards i Genomiske Sciences , vol.  9, nr .  3,15. juni 2014, s.  1275 ( ISSN  1944-3277 , DOI  10.4056 / sigs.4851102 , læst online , adgang 30. august 2017 )
  4. (in) "  International nukleotidsekvensdatabasesamarbejde | INSDC  ” , på www.insdc.org (adgang 30. august 2017 )

Se også

Relaterede artikler

  • Gå ind , NCBI Global Cross-Database Search System.
  • BLAST , en NCBI-software, der muliggør sammenligning af nukleotid- og proteinsekvenser.
  • Listen over Wikipedia-sider, der beskriver en taxon ved hjælp af en NCBI-reference .

eksterne links