Nir Friedman

Nir Friedman Biografi
Fødsel 1967
Uddannelse Tel Aviv
University Stanford University
Aktiviteter Bioinformatiker , datalog
Andre oplysninger
Arbejdede for Det hebraiske universitet i Jerusalem
Mark Maskinindlæring og beregningsbiologi
Tilsynsførende Joseph Y. Halpern
Bemærkelsesværdig elev Dana Pe'er  (en)
Internet side www.cs.huji.ac.il/~nir
Priser EW Beth Specialepris (1998)
ISCB-stipendiat (2014)

Nir Friedman (født 1967) er professor i datalogi og biologi ved det hebraiske universitet i Jerusalem .

Hans forskning fokuserer på kombinationen af maskinlæring og statistisk læring med systembiologi , især inden for områderne regulering af genekspression , transkription og kromatin .

Uddannelse og forskning

Friedman opnået en B. Sc. I Tel Aviv University i 1987 og en M. Sc. I Weizmann Institute i 1992. I 1997 fik han en Ph. D. ved Stanford University under tilsyn af Joseph Y. Halpern , i feltet kunstig intelligens (afhandlingens titel: "  Modelling Beliefs in Dynamic Systems  " ).

Derefter arbejdede han som postdoktorforsker ved University of California i Berkeley , sluttede sig derefter til School of Computer Science , Hebrew University of Jerusalem , først som lektor og derefter som professor.

Hans forskning inkluderer arbejde med Bayesian netværksklassifikatorer (med Danny Geiger og Moises Goldszmid), gennemsnitlig strukturel Bayesian maksimering ( forventning maksimering ), og brugen af Bayesian metoder til dataanalyse til genekspression (med Aviv Regev  (en) , Dana Pe'er  (en) , Eran Segal  (en) , Daphne Koller og David Botstein  (en) ). For nylig har han fokuseret på den sandsynlige grafiske model , genopbygningen af ​​genregulerende netværk, epistase og kromatins rolle i reguleringen af ​​transkription (med Oliver Rando  (en) ).

I 2009 udgav Friedman og Koller en bog om sandsynlige grafiske modeller . Samme år blev han også professor ved Institut for Biovidenskab og åbnede et eksperimentelt laboratorium ved hjælp af robotværktøjer til at undersøge reguleringen af ​​transkription af starteren saccharomyces cerevisiae .

Præmier og anerkendelse

Nir Friedman er en fremtrædende fyr i ISCB (International Society of computational biology) fra 2014. Han modtager Michael Bruno Memorial Award (2010), og han blev tildelt et tilskud fra Det Europæiske Forskningsråd (2009–2014); han blev også tildelt Juludan-prisen (2007) og et stipendium fra Sir Zelman Cowen Universities Fund (2007)

Noter og referencer

(fr) Denne artikel er helt eller delvist hentet fra den engelske Wikipedia- artikel med titlen "  Nir Friedman  " ( se listen over forfattere ) .
  1. "  Nir Friedman  " , på Cs.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 ) .
  2. "  Nir Friedmans laboratorium  " på Systemsbio.cs.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 ) .
  3. "  Curriculum Vitae - Nir Friedman  " , på Cs.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 ) .
  4. "Arkiveret kopi af afhandlingen" (version af 25. april 2012 på internetarkivet )
  5. (in) "  Nir Friedman  " på webstedet Mathematics Genealogy Project
  6. "  The Rachel and Selim Benin School of Computer Science and Engineering  " , på Cs.huji.ac.il (adgang 25. maj 2016 )
  7. "  Nir Friedman - Google Scholar  " , på Scholar.google.com (adgang 25. maj 2016 )
  8. N. Friedman om PubMedAuthorSearch.
  9. "  Bayesian netværksklassifikatorer  " , på Cs.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 )
  10. "  Den Bayesiske strukturelle EM-algoritme  " , på Cs.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 )
  11. N. Friedman , M. Linial , I. Nachman og D. Pe'er , "  Brug af Bayesian-netværk til at analysere ekspressionsdata  ", Journal of Computational Biology , bind.  7, n knogle  3-4, 2000, s.  601–620 ( PMID  11108481 , DOI  10.1089 / 106652700750050961 )
  12. E. Segal , M. Shapira , A. Regev , D. Pe'er , D. Botstein , D. Koller og N. Friedman , "  Modulnetværk: Identifikation af reguleringsmoduler og deres tilstandsspecifikke regulatorer ud fra genekspressionsdata  ", Nature Genetics , vol.  34, nr .  2 2003, s.  166–176 ( PMID  12740579 , DOI  10.1038 / ng1165 )
  13. N. Friedman , "  Inferring Cellular Networks Using Probabilistic Graphical Models  ", Science , bind.  303, nr .  5659, 2004, s.  799–805 ( PMID  14764868 , DOI  10.1126 / science.1094068 )
  14. E. Segal , N. Friedman , D. Koller og A. Regev , "  Et modulkort, der viser betinget aktivitet af ekspressionsmoduler i kræft  ", Nature Genetics , vol.  36, nr .  10, 2004, s.  1090–1098 ( PMID  15448693 , PMCID  2271138 , DOI  10.1038 / ng1434 )
  15. "  Nir Friedman (publikationer)  " , på Cs.huji.ac.il (adgang 25. maj 2016 )
  16. Nir Friedman og Daphne Koller, probabilistiske grafiske modeller: principper og teknikker , MIT Press , 2009, 1231  s. ( ISBN  978-0-262-01319-2 , læs online ).
  17. "  Alexander Silberman Institute of Life Sciences  " , på Bio.huji.ac.il (adgang til 25. maj 2016 ) .
  18. "  Robotic Facility,  " på Systemsbio.cs.huji.ac.il (adgang 25 maj 2016 )
  19. Liste over ISCB-stipendiater .
  20. "  Nir Friedman - Yad Hanadiv  " , på Yadhanadiv.org.il (adgang 25. maj 2016 )
  21. "  Ung HU-biolog vinder australsk pris  " , The Jerusalem Post - JPost.com (adgang 25. maj 2016 ) .

eksterne links