Den indlejrede polymerasekædereaktion ( indlejret PCR), også kaldet indlejret PCR , er en modifikation af den klassiske PCR for at reducere mængden af uspecifikke produkter, der skyldes binding af primerne til uventede steder.
Selve polymerasekædereaktionen er en proces, der amplificerer DNA- sekvenser ved anvendelse af en termoreguleret DNA-polymerase . Produktet kan bruges til sekventering eller analyse, og denne proces er nøglestenen i mange forsknings- og laboratorieanvendelser af genetik, såsom retsmedicinsk videnskab eller DNA-fingeraftryk. Konventionel PCR kræver primere komplementære til enderne af DNA-målet. Binding af primere til forkerte steder er et tilbagevendende problem, der resulterer i amplifikation af uventede sekvenser.
Således gør den indlejrede PCR det muligt ved inddragelse af to par primere, der anvendes successivt til at begrænse dette fænomen, idet det andet par af primere formodes at amplificere en sekvens lokaliseret inden i produktet af den første PCR.