Subtilisin

Struktur af krystalliseret subtilisin ( PDB 1ST2 ) Nøgledata

EF-nr.	EC 3.4.21.62
CAS-nummer	9014-01-1

Enzymaktivitet

Den subtilisin er en serinprotease , som katalyserer den hydrolyse af proteiner med lav specificitet for peptidbinding . Det er fortrinsvis nær en stor rest af aminosyre, der ikke er fyldt . Det blev isoleret fra Bacillus subtilis , deraf navnet, men produceres også af andre bakterier , såsom Bacillus amyloliquefaciens .

Subtilisin af B. subtilis er et protein med 275 rester af aminosyrer . Dens virkningsmekanisme involverer en katalytisk triade, der består af Asp -32- , His -64- og Ser -221- rester : selvom de er fjernt fra hinanden i den primære struktur af proteinet , er disse tre aminosyrer naboer i den tertiære struktur af den enzym , for hvilket de udgør aktive sted . Den carboxylat af sidekæden af Asp-32 danner en hydrogenbinding med protonen af atom af nitrogen af imidazol af His-64 . Det andet nitrogenatom af His-64 danner en hydrogenbinding med protonen af hydroxyl af Ser-221 , hvori atomet oxygen er nucleofil . Denne sidste angreb de peptidbindinger af substrater , med hjælp af amid -sidekæden af den Asn -155 .

Noter og referencer

(i) R. Bott, hr Ultsch, A. Kossiakoff T. Graycar, B. Katz og S. Power , " Den tredimensionelle struktur af Bacillus amyloliquefaciens- subtilisin ved 1,8 A og en analyse af de strukturelle konsekvenser af peroxid inaktivering ” , Journal of Biological Chemistry , bind. 263, nr . 16, 5. juni 1988, s. 7895-7906 ( PMID 3286644 , læs online )

(en) M. Philipp og ML Bender , " Kinetics of subtilisin and thiolsubtilisin " , Molecular and Cellular Biochemistry , vol. 51, n o 1,1983, s. 5-32 ( PMID 6343835 , DOI 10.1007 / BF00215583 , læs online )
(en) Peter NEDKOV, Walter OBERTHÜR og Gerhard BRAUNITZER , " Bestemmelse af den komplette aminosyresekvens af Subtilisin DY og dens sammenligning med de primære strukturer af subtilisinerne BPN ', Carlsberg og Amylosacchariticus " , Biologisk kemi Hoppe-Seyler , bind. 366, nr . 4,April 1985, s. 421-430 ( PMID 3927935 , DOI 10.1515 / bchm3.1985.366.1.421 , læs online )
(en) H. Ikemura, H. Takagi og M. Inouye , " Krav om pro-sekvens til produktion af aktiv subtilisin E i Escherichia coli " , Journal of Biological Chemistry , bind. 262, nr . 16,5. juni 1987, s. 7859-7864 ( PMID 3108260 , læs online )