Den kristendom i Mongoliet , især nestorianske , var den religion, hvor der blev rejst flere Khagans , efter ægteskabet mellem Tolui søn af Djengis Khan til en nestoriansk. 2010-folketællingen tællede 2,1% af de kristne blandt de 2.754.685 indbyggere i landet.
I Indre Mongoliet , som forblev kinesisk efter Mongoliets uafhængighed i 1911, er der også nogle kirker, især i hovedstaden Hohhot .
Djengis Khans mor , Hö'elün var medlem af Merkit- stammen, en stamme, der i det mindste delvist bliver kristnet.
I det XIII th århundrede , i mongolske imperium , fra efterkommerne af Djengis Khan, Tuluy , hans foretrukne søn, giftede prinsessen Soyughaqtani en Kerayit og byggede en kirke nestorianske . Deres sønner Möngke og Kubilai efterfølger ham begge som Khagan og vil blive opdraget med deres brødre Houlagou og Ariq Boqa i den kristne tro, men den mongolske yassa forbyder dem at blive døbt. Under regeringstid af Ögödei , Güyük og Möngke fortsatte kristendommen med at udvikle sig i overensstemmelse med ritiverne i den nestorianske kirke.
Nestorianerne var stadig aktive under Yuan-dynastiet i Indre Mongoliet, især i Wulan-Chabu, hvor Öngüt kontrollerede overgangsstederne mellem nutidens Shanxi , Beijing og Mongoliet.
De Franciscans rejste til den mongolske imperium før og under Yuan dynastiet (periode, hvor omfatter Kina), herunder John Carpin Plan (1245-1247), William af Rubrouck (1253-1254) og Johannes af Montecorvino (1294-1328).
Det kristne kongerige Armenien og de kristne samfund i Asien, såsom Nestorianerne, stolede på mongolerne. Louis IX (kendt som Saint Louis ) indgik en alliance med dem mod saracenerne . Disse udvekslinger var oprindelsen af en hinduistisk, buddhistisk og mere generelt orientalsk indflydelse på kristen kunst.
I 1874 blev bispedømmet Xiwanzi (i Xiwangzi 西 弯子/西 彎子, ), Suiyuan , den nuværende by Hohhot , Indre Mongoliet , sæde for det første apostolske vikariat i Scheut . Han tjente som tilflugtssted for de Vincentians sårbare over for forfølgelse end halvdelen af XIX th århundrede . Søjler af russiske soldater kom Scheutist- missionærerne til hjælp i december 1900 .
Det 14. marts 1922, Den mission sui juris af Ourga grundlægges. Stillingen som overordnet var ledig fra 1931. I 1991 etablerede Mongoliet og Holy See diplomatiske forbindelser, der gjorde det muligt at returnere missionærer. Missionen blev oprettet som den apostoliske præfektur for Ulan Bator den8. juli 2002. Wenceslao Selga Padilla , første overordnede for missionen sui juris og derefter apostolsk præfekt , blev udnævnt til biskop i 2003 og havde denne stilling indtil sin død i 2018.
Ifølge folketællingen i 2010 var der 41.117 kristne i alderen 15 år og derover eller 2,1% af den samlede befolkning.