NdhF

Den chloroplast NDH F -genet ( F -underenheden af NADH dehydrogenase ) findes i alle phyla af vaskulære planter og er højt konserveret . Dens chloroplast-DNA- fragment ligger i den lille, enkeltkopieregion af chloroplastgenomet . Det antages, at dets funktion er at kode for et hydrofobt protein indeholdende 664 aminosyrer . Dens masse vurderes til 72,9 kDa .

Ansøgning

Ndh F DNA-fragmentet har vist sig at være et meget nyttigt værktøj til fylogenetisk rekonstruktion på forskellige taksonomiske niveauer .

Noter og referencer

  1. (i) Ray Neyland og Lowell E. Urbatsch, "  ndhF-chloroplastgenet detekteret i alle vaskulære planteopdelinger  " , Planta , bind.  200, n o  21996, s.  273–277 P ( DOI  10.1007 / bf00208318 , resumé ).
  2. (in) Wenpan Dong Jing Liu Jing Yu Ling Wang og Zhou Shiliang, "  Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluation Plant Phylogeny Taxonomic at Low Levels and for DNA Barcoding  " , PLoS ONE , bind.  7, nr .  4,2012, e35071 ( DOI  10.1371 / journal.pone.0035071 , Bibcode  2012PLoSO ... 735071D , læs online ).
  3. (in) TB Patterson og TJ Givnish, "  fylogeni, samordnet konvergens og fylogenetisk nichekonservatisme i kernen Liliales: indsigt fra rbcL og ndhF sekvensdata  " , Evolution , bind.  56, nr .  22002, s.  233–252 ( DOI  10.1111 / j.0014-3820.2002.tb01334.x , resumé ).
  4. (in) TJ Givnish , BC Pires , SW Graham , A. McPherson , LM Prince , TB Patterson og HS Rai , "  fylogeni af monokotyledoner baseret på det meget informative plastidgen ndhF : bevis for udbredt samordnet konvergens  " , Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany ,2006, s.  28–51 ( læs online ).
  5. (i) TJ Givnish , BC Pires , SW Graham , A. McPherson , LM Prince , TB Patterson og HS Rai , "  Gentagen udvikling af netdyrning og kødfuld frugt Blandt monocots i skyggefulde Bekræfter habitater priori forudsigelser: beviser fra år ndhF fylogeni  " , Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences , bind.  272, nr .  15712005, s.  1481–1490 ( DOI  10.1098 / rspb.2005.3067 ).

Se også