Arabidopsis
Arabidopsis
Arabidopsis thaliana
Venlig
Arabidopsis Heynh. , 1842
Fylogenetisk klassificering
Arabidopsis er en slægt af urteagtige planter af familien af Brassicaceae . De er små planter, der ligner kål og sennep. Denne slægt er af stor interesse, da det indeholder Arabidopsis thaliana , Thalius krabbe eller damer krabbe , en model organisme, der anvendes i plantebiologi og grundlæggende biologi.
Etymologi
Latin "arabis", fra Arabien, Arabien: planter, der ofte vokser i tørre og sandede jordarter, såsom ørkenen i Arabien. "(Flora of Hippolyte Coste ) Græsk" opsis ", aspekt: en arabis vane" (Flora of Paul Fournier )
Omklassificering
I øjeblikket har slægten Arabidopsis ni arter og otte yderligere anerkendte underarter . Denne klassificering er ret ny og er baseret på fylogeniske morfologiske og molekylære studier af O'Kane & Al-Shehbaz (1997, 2003).
Deres analyser bekræfter, at de arter, der tidligere var klassificeret i slægten Arabidopsis, var polyfyletiske . Den seneste omklassificering omplacerer to arter, der tidligere var placeret i slægterne Cardaminopsis og Hylandra, og tre arter af Arabis i slægten Arabidopsis , men udelukker 50 arter, der er blevet omklassificeret i de nye slægter:
Beringia , Crucihimalaya , Ianhedgea , Olimarabidopsis , Pseudoarabidopsis , ... ( Se listen nedenfor )
Alle arter af Arabidopsis er hjemmehørende i Europa, mens to af arterne har store områder, der også strækker sig over Nordamerika og Asien .
Siden 1980'erne er Arabidopsis thaliana opstået som en modelorganisme, der anvendes i det videnskabelige samfund til genetiske og molekylærbiologiske studier. Denne lille plante har et lille genom (ca. 120 Mb), hvis DNA-sekvens af disse fem kromosomer har været fuldt kendt siden 2000.
Liste over arter og varianter
Distribution: Europa: hjemmehørende i Tyskland, Østrig, Hviderusland, Bosnien-Hercegovina, Bulgarien, Kroatien, Tjekkiet, NE Frankrig, Ungarn, N Italien, Letland, Litauen, Makedonien, Polen, Rumænien, Slovakiet, Slovenien, Schweiz, Ukraine og Jugoslavien naturaliseret i Belgien, Danmark, Estland, Finland, Holland, Norge, Rusland og Vestsibir og Sverige fraværende i Albanien, Grækenland, det centrale og sydlige Italien og Tyrkiet.
- A. arenosa subsp. Borbasii
Distribution: Øst-Belgien, Tjekkiet, NE Frankrig, Tyskland, Ungarn, Polen, Rumænien, Slovakiet, Schweiz, Ukraine. ubekræftet tilstedeværelse i Danmark.
Distribution: SE Frankrig.
Distribution: Bosnien, Kroatien.
Distribution: Østrig, Kroatien, Tjekkiet, Tyskland, Italien, Polen, Rumænien, Slovakiet, Slovenien, Schweiz og Ukraine. Sandsynligvis introduceret i Frankrig og uddød i Belgien.
-
Arabidopsis halleri subsp. Ovirensis (Wulfen)
Distribution: Albanien, Østrig, NE Italien, Rumænien, Slovakiet, Slovenien, SO Ukraine, Jugoslavien.
-
Arabidopsis halleri subsp. Gemmifera (Matsumura)
Distribution: Russisk Fjernøsten, NE Kina, Korea, Japan og Taiwan.
Distribution: NE European Russia, Alaska, Canada (Western Ontario to British Columbia), SE, C USA.
Distribution: Østrig, Tjekkiet, England, Tyskland, Ungarn, Island, Irland, N. Italien, Norge, NO Rusland, Sibirien og det russiske Fjernøsten, Skotland, Sverige, Ukraine, Alaska og Yukon. Tilsyneladende uddød i Polen.
-
Arabidopsis lyrata subsp. Kamchatica (Fischer ex DC)
Distribution: Boreal Alaska, Canada (Yukon, Mackenzie District, British Columbia, NE Saskatchewan), Aleutian Islands, E Siberia, Russian Far East, Korea, N China, Japan og Taiwan.
Distribution: Karpaterne, Polen, Rumænien, Slovakiet og E Ukraine.
Distribution: INGEN Italien og sandsynligvis uddød i Schweiz.
Distribution: Fennoscandinavia og Østersøen.
Distribution: Europa og Centralasien, nu naturaliseret over hele verden.
Modelorganisme anvendt i genetik.
Cytogenetisk
Cytogenetiske analyser har vist, at det haploide antal kromosomer er variabelt og kan være n = 5, 8, 13 eller 16.
-
Arabidopsis thaliana ; n = 5 og den komplette DNA-sekvens af denne art har været kendt siden 2001.
-
Arabidopsis suecica ; n = 13 og er en amfidiploid art, der stammer fra hybridiseringen mellem Arabidopsis thaliana og Arabidopsis arenosa.
-
Arabidopsis neglecta ; n = 8 ligesom de mange underarter af A. halleri.
De mange underarter af A. lyrata og A. arenosa kan have enten n = 8 (diploid) eller n = 16 (tetraploid).
A. cebennensis, A. croatica og A. pedemontana blev ikke analyseret cytologisk (i 2005).
Omklassificerede arter
Følgende arter, der tidligere var placeret i slægten Arabidopsis, anses ikke længere for at tilhøre denne slægt:
-
A. bactriana =
-
A. brevicaulis = Crucihimalaya himalaica
-
A. bursifolia = Beringia bursifolia
-
A. campestris = Crucihimalaya wallichii
-
A. dentata = Murbeckiella pinnatifida
-
A. drassiana =
-
A. erysimoides = Erysimum hedgeanum
-
A. eseptata = Olimarabidopsis umbrosa
-
A. gamosepala = Neotorularia gamosepala
-
A. glauca = Thellungiella salsuginea
-
A. griffithiana = Olimarabidopsis pumila
-
A. himalaica = Crucihimalaya himalaica
-
A. huetii = Murbeckiella huetii
-
A. kneuckeri = Crucihimalaya kneuckeri
-
A. korshinskyi = Olimarabidopsis cabulica
-
A. lasiocarpa = Crucihimalaya lasiocarpa
-
A. minutiflora = Ianhedgea minutiflora
-
A. mollis = Beringia bursifolia
-
A. mollissima = Crucihimalaya mollissima
-
A. monachorum = Crucihimalaya lasiocarpa
-
A. mongolica = Crucihimalaya mongolica
-
A. multicaulis = Arabis tibetica
-
A. novae-anglicae = Neotorularia humilis
-
A. nuda = Drabopsis nuda
-
A. ovczinnikovii = Crucihimalaya mollissima
-
A. parvula = Thellungiella parvula
-
A. pinnatifida = Murbeckiella pinnatifida
-
A. pumila = Olimarabidopsis pumila
-
A. qiranica = Sisymbriopsis mollipila
-
A. richardsonii = Neotorularia humilis
-
A. russeliana = Crucihimalaya wallichii
-
A. salsuginea = Thellungiella salsuginea
-
A. sarbalica = Crucihimalaya wallichii
-
A. schimperi = Robeschia schimperi
-
A. stenocarpa = Beringia bursifolia
-
A. stewartiana = Olimarabidopsis pumila
-
A. stricta = Crucihimalaya stricta
-
A. taraxacifolia = Crucihimalaya wallichii
-
A. tenuisiliqua = Arabis tenuisiliqua
-
A. tibetica = Crucihimalaya himalaica
-
A. tibetica = Arabis tibetica
-
A. toxophylla = Pseudoarabidopsis toxophylla
-
A. trichocarpa = Neotorularia humilis
-
A. trichopoda = Beringia bursifolia
-
A. tschuktschorum = Beringia bursifolia
-
A. tuemurnica = Neotorularia humilis
-
A. verna = Drabopsis nuda
-
A. virgata = Beringia bursifolia
-
A. wallichii = Crucihimalaya wallichii
-
A. yadungensis =
Kilder
- O'Kane Jr, SL og Al-Shehbaz, IA (1997). En synopsis af Arabidopsis (Brassicaceae): Novon 7: 323-327.
- Al-Shehbaz, IA, O'Kane, Steve L. (2002). Taxonomi og fylogeni af Arabidopsis (Brassicaceae). Arabidopsis-bogen: 1-22. online version.
- O'Kane Jr, SL og Al-Shehbaz, IA (2003). Fylogenetisk position og generiske grænser for Arabidopsis (Brassicaceae) baseret på sekvenser af nukleart ribosomalt DNA: Annaler fra Missouri Botaniske Have 90 (4): 603-612
Noter og referencer
-
Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., Adgang til 28. juli 2020
eksterne links