Chymotrypsin
Den chymotrypsin er en peptidase fordøjelsessystem udskilles af pancreas , af familien af serinproteaser , som katalyserer den proteolyse . Det kodes af to gener placeret på kromosom 16 , hvis produkt er et proenzym kaldet chymotrypsinogen , som skal aktiveres senere for at give selve chymotrypsin. Dette enzym hydrolyserer fortrinsvis proteinerne i niveauet for peptidbindingerne nedstrøms for en rest af tyrosin , tryptophan , phenylalanin , methionin eller leucin . Det aktive sted for chymotrypsin har en hydrofob lomme, i hvilken aminosyren i substratet er anbragt . Dette muliggør, at placeringen af bindingen spaltes overfor den katalytiske serin.
Chymotrypsin| EF-nr. | EC |
|---|---|
| CAS-nummer |
| IUBMB | IUBMB-post |
|---|---|
| IntEnz | IntEnz-visning |
| BRENDA | BRENDA indgang |
| KEGG | KEGG-indgang |
| MetaCyc | Metabolisk vej |
| PRIAM | Profil |
| FBF | Strukturer |
| GÅ | AmiGO / EGO |
Syntese og aktivering
Chymotrypsin produceres af bugspytkirtlen i en inaktiv form kaldet chymotrypsinogen . Aktivering skyldes trypsin som skærer dette molekyle i to kæder, derefter ved chymotrypsin sig selv under trans -proteolysis, giver ved enden et kompakt globulært struktur af tre kæder forbundet af to disulfidbroer og foldet i 2 domæner af 120 aminosyrer.
Disse domæner anvender konformationen af en β-tønde dannet af 6 β-tråde.
Det aktive sted ligger i en sprække, der grænser op til de 2 områder. Det binder substratet på niveauet med 2 regioner (region 214-216, ikke-specifik binding og region 189-216 og 226, specifik binding).
Handlingsmekanisme
Chymotrypsin er involveret i proteolysen af proteiner i fordøjelsessystemet hos pattedyr og andre levende væsener. Det katalyserer spaltningen af polypeptidkæder ved hydrolyse , en mekanisme, der oprindeligt var ekstremt langsom uden en aktivator.
Chymotrypsin angriber de potentielt nukleofile carbonylgrupper, der er involveret i en peptidbinding gennem serin 195, som binder til dets substrat til dannelse af et kovalent substrat-enzym-mellemprodukt. Det aktive sted for enzymet involverer også aminosyrerne His57, Asp102 og Gly193.
Det er blevet vist, at reaktionen af chymotrypsin med dets substrat forekommer i to faser: en indledende burst-fase i begyndelsen af reaktionen, derefter en steady state-fase, der følger Michaelis-Menten-loven .
Chymotrypsin skal absolut holdes koldt for at opretholde den enzymatiske aktivitet.
-
Virkningsmekanisme for chymotrypsin.
Sekvens
Sekvens af chymotrypsinogen B1 (gener 16q23 og 16q24.1)
10 20 30 40 50 60 MASLWLLSCF SLVGAAFGCG VPAIHPVLSG LSRIVNGEDA VPGSWPWQVS LQDKTGFHFC 70 80 90 100 110 120 GGSLISEDWV VTAAHCGVRT SDVVVAGEFD QGSDEENIQV LKIAKVFKNP KFSILTVNND 130 140 150 160 170 180 ITLLKLATPA RFSQTVSAVC LPSADDDFPA GTLCATTGWG KTKYNANKTP DKLQQAALPL 190 200 210 220 230 240 LSNAECKKSW GRRITDVMIC AGASGVSSCM GDSGGPLVCQ KDGAWTLVGI VSWGSDTCST 250 260 SSPGVYARVT KLIPWVQKIL AANSekvens af chymotrypsinogen B2 (gen 16q23.1)
10 20 30 40 50 60 MAFLWLLSCW ALLGTTFGCG VPAIHPVLSG LSRIVNGEDA VPGSWPWQVS LQDKTGFHFC 70 80 90 100 110 120 GGSLISEDWV VTAAHCGVRT SDVVVAGEFD QGSDEENIQV LKIAKVFKNP KFSILTVNND 130 140 150 160 170 180 ITLLKLATPA RFSQTVSAVC LPSADDDFPA GTLCATTGWG KTKYNANKTP DKLQQAALPL 190 200 210 220 230 240 LSNAECKKSW GRRITDVMIC AGASGVSSCM GDSGGPLVCQ KDGAWTLVGI VSWGSRTCST 250 260 TTPAVYARVA KLIPWVQKIL AANNoter og referencer
- Værdierne for massen og antallet af rester, der er angivet her, er værdierne for proteinforløberen, der er resultatet af translationen af genet , før posttranslationsmodifikationer og kan afvige væsentligt fra de tilsvarende værdier Til det funktionelle protein .