Co-infektion

I mikrobiologi er co-infektion (eller multipel infektion ) den samtidige infektion af en vært af flere patogener . På trods af manglen på tilgængelige data om den samlede prævalens hos mennesker anses dette fænomen for at være meget almindeligt, hvis ikke mere almindeligt end simpel infektion. For eksempel påvirker co-infektion, der involverer helminter, omkring 800 millioner mennesker over hele verden.

Typer af co-infektion

Inden for medicin ( virologi , bakteriologi ) er co-infektion den samtidige infektion af en celle af mindst to forskellige virale eller bakterielle enheder . For eksempel kan co-infektion af leverceller med hepatitis B-virus og hepatitis D-virus føre ud over den oprindelige infektion til superinfektion .
I tilfælde af bakterier kan det være to genetisk forskellige stammer af den samme bakterie eller to forskellige arter. For eksempel af to forskellige borrelier i tilfælde af en Lyme-sygdom eller af en borrelia "associeret" med en anden bakteriel eller viral patogen, der kunne have været overført af den samme flåtbid (det er ret hyppigt, at et samme flåt bærer to eller flere patogener af forskellige arter; således i 1000 Ixodes ricinus- flåter opsamlet i et skovklædt rekreativt område i Thüringen (Central-Tyskland) blev Borrelia spp., Babesia spp. spp Anaplasma. spp Rickettsia., Coxiella burnetii og Francisella tularensis testet ; 43,6% af disse blev testet flåter blev inficeret med mindst en af disse patogener, og i 8,4% af tilfældene eksisterede to forskellige patogener samtidig i kryds (og 3 eller mere i 1,6% af den undersøgte batch).

Co-infektion mellem TB og HIV er almindelig, og i nogle lande er op til 80% af TB-patienterne HIV-positive. Den potentielle sammenkoblingsdynamik mellem disse to smitsomme sygdomme har længe været kendt. Andre almindelige tilfælde af co-infektion inkluderer AIDS eller polymikrobielle infektioner såsom Lyme sygdom .

Ifølge en nylig undersøgelse (2019) er flere virale infektioner flere hos små børn end hos voksne og forbundet med en højere risiko for at udvikle en akut nedre luftvejsinfektion (IAVRI eller LRTI for engelsktalende), men uden statistisk forudsigelse af en forværring af sygdommen. Interaktionen mellem flere vira og den samme vært er kompleks og stadig dårligt forstået for flere typer virusinfektioner.

Hvis en anden infektion forværres, kaldes den første superinfektion .

Epidemiologi

Fremskridt inden for sekventeringsteknikker afslører lidt mere, at flere infektioner er reglen snarere end undtagelsen. Dette gælder for virale, bakterielle eller makro-parasitære infektioner. I tilfælde af humane papillomavirus (HPV) er for eksempel næsten halvdelen af infektioner hos unge kvinder forårsaget af mere end en type HPV.

Overvejelse af flere infektioner er særlig vigtig, fordi spredningen af et patogen kan interferere med et andet patogen. For eksempel har co-infektion med malaria og HIV vist sig at øge spredningen af begge parasitter.

Hyppigheden af flere infektioner har ført til en spredning af termer, der ofte betegner den samme proces. Afhængigt af disciplinen vil vi således tale om multipel infektion, coinfektion, superinfektion, polymikrobiel infektion, superinfektion eller forskellige infektioner. Matematiske epidemiologiske tilgange gør det muligt at bevæge sig mod en typologi af de forskellige typer af flere infektioner og demonstrere, at der opstår 7 ikke-trivielle infektionsmønstre.

Klinisk betydning af co-infektion

Det er tydeligt, når patogener interagerer ( positivt eller negativt).

Positive interaktioner resulterer i syndemism hvori sygdom transmission og progression er forbedret.
Tværtimod er mikrobiel interferens blandt de negative saminfektionsinteraktioner. Dette er tilfældet, når en bakterieart undertrykker virulens eller kolonisering af en anden bakterie, såsom Pseudomonas aeruginosa, og undertrykker dannelsen af patogene kolonier af Staphylococcus aureus .

Desuden kan co-infektion undertiden gøre diagnosen vanskeligere, idet en af patogenerne kan maskere eller ændre symptomerne på den anden og omvendt.

Epidemiologisk betydning af co-infektioner

Co-infektion foretrækkes af cirkulationen af mikrober knyttet til antropiseringen af verden, den store acceleration og klimaændringerne . Det er dog også en af de mekanismer, der bruges af bakterier og vira til at udvikle sig sammen med deres værter, ofte i anledning af et fald i immunitet, som kan induceres af en af patogenerne (vira som eksempel): co-infektion fremmer fænomenet genetisk rekombination , der fremmer nye stammer i vira og bakterier , som i sidste ende vil forårsage nye sygdomme , nogle gange zoonotiske eller komplicere diagnosen og behandlingen af patienter. For eksempel :

I tilfælde af influenza er virusbakterier co-infektion almindelig og kan være dødsårsagen hos voksne eller øget sværhedsgrad af influenza hos børn.
i tilfælde af flåtbårne sygdomme er co-infektioner meget hyppige, fordi flåter ofte selv er inficeret med flere borrelia og andre patogener, som de også kan co-inokulere under deres lange bid; en nylig undersøgelse viste, at 65% af patienterne med flåtbåren sygdom også producerer immunrespons på andre mikrober; denne undersøgelse “etablerede en kausal sammenhæng mellem patienter med krydsbåren sygdom og co-infektioner forbundet med denne sygdom af essentielle opportunistiske mikrober (i henhold til Bradford Hill-kriterierne ). Denne undersøgelse viste en 85% chance for, at en patient med Lyme-sygdom, tilfældigt taget, vil reagere på Borrelia og andre relaterede mikrober snarere end blot Borrelia . Der er behov for et paradigmeskift i sundhedspolitikkerne for at diagnosticere flåtbårne sygdomme, så patienter også kan testes og behandles for opportunistiske infektioner ” .

Nogle myg kan under den samme bid podes både Dengue-virussen og Chikungunya- virussen .
Den hiv / aids som en pandemi ekspansion kan lette, blandt andet købet af leishmaniasis (visceral især, sjældent hud);
co-infektioner af hepatitis findes også (hepatitis B og C).
i tilfælde af koronavirus inden for flagermuskolonier: mange alfacoronavirus og betacoronavirus er fundet i disse flagermus overalt på planeten.
R. sinicus er en af de berørte arter. De coronavirus er opgjort i 2012 til at 2013 i forbindelse med en menneske- pit opgav Mojiang County ( Yunnan , Kina) co-bruges som levested og tilflugtssted for seks forskellige arter af flagermus , ofte fundet i hulen ( Rhinolophus sinicus , Rhinolophus affinis , Hipposideros pomona , Miniopterus schreibersii , Miniopterus fuliginosus og Miniopterus fuscus ) ; der er fundet en forskelligartet gruppe af coronavirus i alle disse arter. To bétacoronavirus, der endnu ikke var klassificeret, blev derefter fundet såvel som en ny stamme af typen coronavirus SARS og potentielt nye arter af bétacoronavirus. Det skal også bemærkes, at co-infektion med flere coronavirus er blevet påvist hos individer af disse seks arter af flagermus, hvilket kan fremme viral rekombination og derfor fremkomsten af nye virale stammer. Dette arbejde bekræftede, at flagermus er et naturligt reservoir af coronavirus og en potentiel kilde til virale zoonoser . Ved starten af Covid-19-pandemien blev denne hestesko-flagermus mistænkt for at være reservoiret for den nye SARS-CoV-2- virus , årsagen til Covid-19 , men det blev senere fundet, at Pangolin husede en virus klart tættere. Faktisk har den nye virus 99% ligheder med pangolin coronavirus , et dyr, der almindeligvis pocheres i Asien og især sælges på Huanan-markedet. SARS-CoV-2 kunne ikke desto mindre have en fælles forfader til stammen, der inficerer Pangolin og til de pandemistammer , der spredes på planeten i slutningen af 2019 og i 2020.

Mikrobiel udvikling

Flere infektioner er en vigtig drivkraft for mikrobiel udvikling . Konkurrencen om værtsressourcerne tilføjer faktisk et niveau af naturlig udvælgelse: den foretrukne parasitiske stamme er ikke kun den, der transmitteres bedst i befolkningen, men også den, der formår at vinde intrakonkurrencen . . Dette har store konsekvenser for processerne for udvikling af virulens . I tilfælde af udvikling af antibiotikaresistens kan flere infektioner også fremme vandrette overførsler af resistensgener mellem forskellige bakterielle genotyper. Disse processer er komplicerede at forudsige, fordi de involverer både epidemiologi og evolution (vi taler om evolutionær epidemiologi ).

Noter og referencer

(in) FE Cox , " Samtidige infektioner, parasitter og immunresponser " , Parasitology , bind. 122 Suppl, 2001, S23–38 ( PMID 11442193 )
(i) TN Petney og RH Andrews , " Multiparasite samfund i dyr og mennesker: hyppighed, struktur og patogene betydning " , International Journal for parasitologi , vol. 28, nr . 3, 1998, s. 377–93 ( PMID 9559357 , DOI 10.1016 / S0020-7519 (97) 00189-6 )
(i) DW Crompton , " Hvor meget menneskelig helminthiasis er der i verden? ” , The Journal of parasitology , bind. 85, nr . 3, 1999, s. 397–403 ( PMID 10386428 , DOI 10.2307 / 3285768 , læs online )
Anke Hildebrandt, Jan Franke, Gernot Schmoock, Katharina Pauliks, Angela Krämer og Eberhard Straube, mangfoldighed og sameksistens af flåtbårne patogener i det centrale Tyskland ; Journal of Medical Entomology 48 (3): 651-655. 2011 doi: 10.1603 / ME10254 ( Abstrakt , på engelsk);
(i) " Tuberkulose og HIV " , Verdenssundhedsorganisationen
(i) G Di Perri , M Cruciani , MC Danzi , R Luzzati , G De Checchi , M Malena S Pizzighella , R Mazzi og M Solbiati , " nosokomiel epidemi af aktiv tuberkulose Blandt HIV-inficerede patienter " , Lancet , Vol. 2, nr . 8678-8679, 1989, s. 1502–4 ( PMID 2574778 )
(i) SD Lawn , " AIDS i Afrika: indvirkning coinfektioner om patogenesen af HIV-1-infektion " , The Journal of Infection , vol. 48, nr . 1, 2004, s. 1–12 ( PMID 14667787 , DOI 10.1016 / j.jinf.2003.09.001 )
(i) PD Mitchell , KD Reed og JM Hofkes , " Immunoserologic dokumentation for samtidig infektion med Borrelia burgdorferi, Babesia microti, og menneskelige granulocytisk Ehrlichia arter i Wisconsin og Minnesota beboere i " , Journal of Clinical Microbiology , vol. 34, nr . 3, 1996, s. 724–7 ( PMID 8904446 , PMCID 228878 )
(da) Chun-Yu Yen og Wan-Tai Wu , " Virale etiologier af akutte luftvejsinfektioner blandt indlagte børn - En sammenligning mellem enkelt- og multiple virusinfektioner " , på Journal of Microbiology, Immunology and Infection ,december 2019( DOI 10.1016 / j.jmii.2019.08.013 , adgang til 17. april 2020 ) ,s. 902–910
(i) Jonathan J. Juliano , Kimberly Porter , Victor Mwapasa og Rithy Sem , " udsættes i malaria-host mangfoldighed og estimering populationsdiversitet ved capture-recapture anvendelse massiv parallel pyrosekventering " , Proceedings of National Academy of Sciences , vol. 107, nr . 46,16. november 2010, s. 20138–20143 ( ISSN 0027-8424 og 1091-6490 , PMID 21041629 , DOI 10.1073 / pnas.1007068107 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
(i) Oliver Balmer og Marcel Tanner , " Udbredelse og konsekvenser af multiple-stamme-infektioner " , The Lancet Infectious Diseases , vol. 11, nr . 11,2011, s. 868–878 ( DOI 10.1016 / s1473-3099 (11) 70241-9 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
Anil K. Chaturvedi , Hormuzd A. Katki , Allan Hildesheim og Ana Cecilia Rodríguez , " Human papillomavirusinfektion med flere typer: Coinfektionsmønster og risiko for livmoderhalssygdom ", The Journal of Infectious Diseases , bind. 203, nr . 7,1 st april 2011, s. 910–920 ( ISSN 0022-1899 , DOI 10.1093 / infdis / jiq139 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
(i) Laith J. Abu-Raddad , Padmaja Patnaik og James G. Kublin , " Dual infektion med HIV og malaria Fuels spredning af begge sygdomme i Afrika syd for Sahara " , Science , vol. 314, nr . 58058. december 2006, s. 1603–1606 ( ISSN 0036-8075 og 1095-9203 , PMID 17158329 , DOI 10.1126 / science.1132338 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
Mircea T. Sofonea , Samuel Alizon og Yannis Michalakis , “ Eksponering af mangfoldigheden af flere infektionsmønstre ”, Journal of Theoretical Biology , bind. 419,21. april 2017, s. 278–289 ( DOI 10.1016 / j.jtbi.2017.02.011 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
(i) LR Hoffman , E. Déziel , DA D'Argenio , F. Lepine , J. Emerson , S. McNamara , RL Gibson , BW Ramsey og SI Miller , " Selection for Staphylococcus aureus lille koloni-varianter følge af vækst i tilstedeværelsen af Pseudomonas aeruginosa ” , Proceedings of the National Academy of Sciences , vol. 103, 2006, s. 19890 ( PMCID 1750898 , DOI 10.1073 / pnas.0606756104 )
(i) Linda Munson og Karen A. Terio , " klimaekstremer fremme samarbejdet fatale infektioner Under hundesyge Epidemier i afrikansk Lions " på PLoS ONE ,25. juni 2008( ISSN 1932-6203 , PMID 18575601 , PMCID PMC2435602 , DOI 10.1371 / journal.pone.0002545 , adgang til 10. maj 2020 ) , e2545
Floret, D. (1997). Virus-bakterier co-infektioner. Pædiatrisk arkiv, 4 (11), 1119-1124 ( abstrakt )
Chahar, HS, Bharaj, P., Dar, L., Guleria, R., Kabra, SK, & Broor, S. (2009). Co-infektioner med chikungunya-virus og dengue-virus i Delhi, Indien . Nye smitsomme sygdomme, 15 (7), 1077
Cruz, I., Nieto, J., Moreno, J., Cañavate, C., Desjeux, P., & Alvar, J. (2006). Leishmania / HIV co-infektioner i det andet årti .
Desjeux, P., Piot, B., O'neill, K., & Meert, JP (2001). Leishmania / HIV co-infektioner i Sydeuropa . Med Trop, 61, 187-193.
(i) P. Desjeux og J. Alvar , " Leishmania / hiv co-infektioner: epidemiologi i Europa " , i Annals of Tropical Medicine & Parasitologi ,2. oktober 2003( ISSN 0003-4983 , DOI 10.1179 / 000349803225002499 , hørt 10. maj 2020 ) ,s. 3–15
Larsen, C., Pialoux, G., Salmon, D., Antona, D., Piroth, L., Le Strat, Y., ... & Delarocque-Astagneau, E. (2005). Udbredelse af co-infektioner med hepatitis B- og C-vira i HIV + -populationen , Frankrig, juni 2004. Bull Epidemiol Hebd, 23, 109-12.
(da) Xing-Yi Ge , Ning Wang , Wei Zhang og Ben Hu , " Sameksistens af flere koronavirus i flere flagermuskolonier i en forladt mineskaft " , Virologica Sinica , bind. 31, nr . 1,1 st februar 2016, s. 31–40 ( ISSN 1995-820X , DOI 10.1007 / s12250-016-3713-9 , læst online , adgang til 17. marts 2020 )
Xiuguang Mao , Guimei He , Junpeng Zhang og Stephen J. Rossiter , ” Lineage Divergence and Historical Gene Flow in the Chinese Horseshoe Bat (Rhinolophus sinicus) ”, PLoS ONE , bind. 8, nr . 225. februar 2013( ISSN 1932-6203 , PMID 23451086 , PMCID 3581519 , DOI 10.1371 / journal.pone.0056786 , læst online , adgang til 17. marts 2020 )
Hervé Morin, " Coronavirus: Kunne Pangolin fungere som en mellemvært?" ", Le Monde ,7. februar 2020( læs online , konsulteret den 8. februar 2020 ) ; ifølge New China , det officielle nyhedsbureau, The7. februar.
(i) Andrew F. Læs og Louise H. Taylor , " økologi Genetisk Diverse Infektioner " , Science , vol. 292, nr . 5519,11. maj 2001, s. 1099–1102 ( ISSN 0036-8075 og 1095-9203 , PMID 11352063 , DOI 10.1126 / science.1059410 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
Nicole Mideo " Parasit tilpasninger til konkurrencen inden for værten ," Trends in Parasitology , Vol. 25, nr . 6,2009, s. 261–268 ( DOI 10.1016 / j.pt.2009.03.001 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
(i) Samuel Alizon , Jacobus C. de Roode og Yannis Michalakis , " Multiple infektioner og af Udviklingen i virulens " , Ecology Letters , vol. 16, nr . 4,1 st april 2013, s. 556-567 ( ISSN 1461-0248 , DOI 10.1111 / ele.12076 , læst online , adgang til 10. september 2017 )
Samuel Alizon, er det seriøs læge Darwin? : evolution, mikrober og os , Éditions du Seuil,2016( ISBN 2021102920 , OCLC 940971773 , læs online )