Du kan dele din viden ved at forbedre den ( hvordan? ) I henhold til anbefalingerne fra de tilsvarende projekter .
Tomatbrun rugosefrugtvirus
Tomat brun rynketType | Virus |
---|---|
Gruppe | Gruppe IV |
Familie | Virgaviridae |
Venlig | Tobamovirus |
Den brune ru frugt af tomat virus (ToBRFV, tomat rugose brun frugt virus ) er en art af virus af slægten tobamovirus (familie virgaviridae ) nyligt beskrevet. Symptomer på grund af dette phytovirus blev først beskrevet i Israel i 2014 på tomatafgrøder. Sygdommen har været til stede på alle kontinenter siden 2019: Asien, Europa, Afrika, Nord- og Sydamerika, hvor denne hurtige spredning blev forklaret ved overførsel af forurenede frø. Det er en spirende virus, der påvirker tomat- og peberafgrøder såvel som nogle ukrudtsarter , herunder sort natskygge .
Tomat afgrøder er også påvirket af en lang række vira (136 arter er blevet identificeret på verdensplan), blandt hvilke omkring ti nye vira, af slægterne Torradovirus , Crinivirus , Ilarvirus , Anulavirus , tospovirus , Potexvirus og Begomovirus , er blevet rapporteret siden årene 1990-2000. Tre vira af slægten Tobamovirus , der er nært beslægtet med den nye virus, er særligt vigtige for tomatafgrøder (TMV, tobaksmosaikvirus , ToMV, tomatmosaikvirus og PMMV, lys pebermottelvirus . )).
Ligesom alle vira af slægten tobamovirus , ToBRFV er en stiv, ikke-kappeklædte stang med spiralformet symmetri. Den virionet er omkring 18 nm i diameter og 300-310nm lang.
Den genomet , lineære, monopartite, består af enkeltstrenget RNA med positiv polaritet, hvis størrelse er ca. 6,3 til 6,5 kb. 3'-enden har en tRNA-type struktur. 5'-enden har en methyleret nukleotidhætte (m7G5'pppG).
Genomisk analyse viste, at det komplette genom af en typisk stamme består af 6391 til 6393 nukleotider, og at isolaterne er genetisk nært beslægtede med hinanden. Fylogenetisk analyse viste, at den genomiske sekvens af ToBRFV adskiller sig fra den for ToMV ( tomatmosaikvirus ) eller TMV ( tobaksmosaikvirus ) med 18% og antyder, at den kan være kommet fra en fælles forfader til disse to vira.
På bladene af inficerede planter er symptomerne forårsaget af denne virus udseendet af mere eller mindre alvorlige mosaikpletter og undertiden gulfarvning af venerne og indsnævring af bladbladet . Disse symptomer vises oftest på de øverste blade. På inficeret frugt er der gule pletter og grove brune pletter på overfladen. Nogle gange dannes nekrotiske læsioner (brune, døde) på frugtstænglen og bægeret. Sygdommen har en tendens til at være mere alvorlig i tider med stress, såsom de varmeste eller koldeste perioder om vinteren. Symptomerne varierer i sværhedsgrad afhængigt af forskellige faktorer: plantens alder på infektionstidspunktet (symptomerne er mere alvorlige på unge planter), sorten ( cultivar ) og miljøforholdene (temperatur og lys). Sygdommen kan forårsage udbyttetab fra 30 til 70%.
Spredning og udbredelse af ToBRFV er primært mekanisk, enten gennem direkte plante-til-plante kontakt, eller gennem stiklinger eller scions, der anvendes til plantning, eller indirekte gennem mennesker og udstyr i kulturel praksis. Gelænder (hænder, værktøj, udstyr, forurenet tøj osv. .) eller ved at cirkulere vand . Overførsel af denne virus med frø er mistænkt, men det er ikke blevet demonstreret, men eksternt forurenede frø kan dog bidrage til spredning af virussen over lange afstande. Ligesom andre Tobamoviruses , kan dette virus forblive infektiøse for måneder på frø, i planterester eller i jordbunden, og kan inficere mange ukrudtsplanter , som derefter tjener som inokulum reservoirer for infektion. Af kulturen.
I nogle tilfælde kan der findes andre transmissionsmekanismer. For eksempel i Det Forenede Kongerige, hvor humlebier ( Bombus sp.) Anvendes i vid udstrækning til at bestøve tomatafgrøder, er det blevet bekræftet, at disse insekter kan overføre plantevira og viroider, herunder ToBRFV, i drivhuse.
De vigtigste værtsplanter for denne virus er tomater ( Solanum lycopersicum ) og chili / peber ( Capsicum sp.). Nicotiana benthamiana , Nicotiana glutinosa , Nicotiana sylvestris , Nicotiana tabacum (tobak) har vist sig ved podningsforsøg at udvikle symptomer, og at ukrudt såsom Chenopodiastrum vægmaleri og Solanum nigrum kan fungere som reservoirer for ToBRFV. I 2019 blev ToBRFV rapporteret at være til stede i en aubergineprøve indsamlet fra staten Sinaloa ( Mexico ).
Ingen dyrkede tomatvarianter har gener til resistens over for ToBRFV.
De foranstaltninger, der anbefales af officielle organer, er i det væsentlige strenge profylaktiske foranstaltninger, især desinficering af værktøj, fjernelse af afgrøderester, brug af frø eller planter, der er certificeret som gratis.
Når der påvises inficerede planter (diagnose skal bekræftes af et specialiseret laboratorium), anbefales det omhyggeligt at fjerne symptomatiske planter og ødelægge dem ved nedgravning eller forbrænding for at undgå luftaffald.
Det bør også tages i betragtning, at asymptomatiske planter kan være bærere af virussen: på den ene side tager det flere dage fra den oprindelige infektion, før symptomerne vises, på den anden side kan nogle sorter forblive asymptomatiske på trods af infektion med virussen .
ToBRFV-virussen blev inkluderet i januar 2019 på A1-alarmlisten for Den Europæiske og Middelhavsplantebeskyttelsesorganisation (EPPO).
Den Europæiske Union vedtog26. september 2019 en "gennemførelsesafgørelse", der supplerer bestemmelserne i Rådets direktiv 2000/29 / EF af 8. maj 2000om beskyttelsesforanstaltninger mod indførelse i Fællesskabet af organismer, der er skadelige for planter eller planteprodukter, og mod deres spredning inden for Fællesskabet, og som kræver, at medlemsstaterne træffer forskellige foranstaltninger for at forbyde introduktion af virusorganismen i Den Europæiske Union og kontrollere introduktion og bevægelse inden for Unionen af frø og planter til plantning. Kommissionens gennemførelsesforordning (EU) 2020/1191 af 11. august 2020 fastlægger foranstaltninger til at forhindre introduktion og spredning af virussen i Unionen. Dets bilag definerer de prøveudtagningsplaner, der skal anvendes på frø og planter beregnet til plantning, samt de analysemetoder, der skal bruges til at opdage og identificere den skadelige organisme (RT-PCR og Elisa) efter behov, og hvad der skal gøres i tilfælde af af et positivt resultat.
I USA udstedte APHIS ( Animal and Plant Health Inspection Service )15. november 2019en “føderal ordinance” om amerikansk import af tomater ( Solanum lycopersicum ) og peberfrugter ( Capsicum sp.) værter for tomatbrunfrugtvirus (ToBRFV), som pålægger kontrol på oprindelsessteder i lande, der er ramt af sygdom og sandsynligvis eksporterer friske tomater eller peberfrugter til USA ( Mexico , Israel , Holland ) samt Canada som en reeksportør af mexicanske produkter for at sikre, at produkterne er fri for sygdomssymptomer.
Den første epidemi af denne nye virussygdom blev erklæret i oktober-november 2014 i landsbyen Ohad (det sydlige Israel ) i tomatafgrøder dyrket i drivhuse på ca. 12 ha. Disse var tomater af sorterne 'Mose' og 'Ikram', ikke podet eller podet på cv grundstammen . 'Arnold'. De observerede symptomer var en let eller mere markeret mosaik på bladene med lejlighedsvis krympning af bladene og gule pletter på frugterne, der påvirkede 10 til 15% af frugterne på hver symptomatisk plante. Sygdommen spredte sig over hele landet inden for et år på grund af handel med inficerede frø eller planter.
I april 2015, i Jordan viste drivhustomater ( Solanum lycopersicum , cv. 'Candela') milde bladsymptomer i slutningen af sæsonen, men alvorlige symptomer på brun ruhed på frugterne, som følgelig mistede al markedsværdi. Forekomsten af sygdommen var tæt på 100%. Typen af symptomer og fordelingsmønsteret for sygdommen i de berørte plot foreslog en viral ætiologi.
Disse symptomer ligner dem, der er forårsaget af Tobamovirus , herunder tobaksmosaikvirus (TMV) og tomatmosaikvirus (ToMV). Imidlertid tomat kultivarer , der udviser symptomer havde Tm-2 2 -genet , som giver dem resistens over for disse to virus.
Viral RNA-analyse og genom-sekventering fastslog, at der var en stærk identitet mellem de jordanske og israelske isolater, og at det var en ny virus, nært beslægtet med TMV og ToMV, i gruppen af Tobamovirus , for hvilken navnet Tomato brown rugose fruit virus ( Tomat brun ru frugt virus ), forkortet TBRFV eller ToBRFV, er blevet foreslået.
Virussen spredte sig derefter til Jordan i 2015, også til tomater med Tm-2 2- genet og til Saudi-Arabien . Siden 2018 har det nået Tyskland , Californien , Mexico , hvor udryddelseskampagner er i gang. I 2019 nås nye lande: Canada ( Ontario ), Tyrkiet , Italien , Kina , Palæstina og Det Forenede Kongerige . Virussen er også blevet rapporteret i Holland , Chile , Etiopien og Sudan , men dets tilstedeværelse er ikke bekræftet.
I Frankrig , ifølge en pressemeddelelse fra Ministeriet for Landbrug i16. februar 2020, er tilstedeværelsen af virussen stærkt mistænkt på en gård i Finistère, der er begrænset.