Mycobacteriaceae

Mycobacteriaceae Kultur af Mycobacterium tuberculosis på Löwenstein Jensen medium Klassifikation

Reger	Bakterie
Afdeling	Actinobakterier
Klasse	Actinobakterier
Bestille	Actinomycetales
Underordre	Corynebacterineae

Familie

Mycobacteriaceae
Chester 1897 emend. Gupta et al. 2018

Genrer med lavere rang

• Mycobacterium
• Mycolicibacter
• Mycolicibacillus
• Mycolicibacterium
• Mycobacteroides
• Bactoderma
• Stibiobacter

De mycobakterier (den familie af Mycobacteriaceae ) er baciller formål, undertiden krumme, ikke blege eller under påvirkning af stærke syrer eller under indflydelse af alkohol .

Mykobakterier defineres således som "  syrefast baciller  " eller AFB .

Konvolutegenskaber

Syre-alkoholresistensegenskaben er knyttet til selve strukturen i deres cellevæg, som danner en ægte voksagtig og beskyttende indhylning på grund af dens usædvanlige rigdom i fedtsyrer og lipider (23% til 1-2% i andre bakterier).

Vægens skelet består af peptidoglycan (også kendt som murein), der er forbundet så kovalent til et glycosid: arabinogalactan , selv forestret med mycolsyre , fedtsyrer individuelle superlange. De danner derefter voks.

Tilstedeværelsen af ​​disse voks af arabinogalactanmycolater i væggen fastgjort på peptidoglykanen er årsagen til AAR ved:

• Den betydelige hydrofobicitet, som gør det vanskeligt for farve- og blegemidler at trænge ind.
• Bindingen af fuchsin til mycolic syrer, en binding, som også vil bibeholde fuchsin, der er trængt ind i bacillus.

Det ydre lag, en slags kapsel, har kompleks sammensætning og struktur. I dag anslås det, at der er:

• et ydre lag bestående af polysaccharider og proteiner (inklusive en alanindehydrogenase ) og et par lipider , hvis art stadig er et mysterium (lipoprotein?);
• et indre lag meget rigere på lipider.

Økologi

Disse bakterier er fakultative intracellulære og kan overleve i et år i kvæg fæces og på jord.

Habitat

De findes i naturen, hvor de lever som saprofytter , men også hos mennesker og dyr, hvor de opfører sig enten som kommensaler eller som patogener . Nogle arter er strenge patogener for mennesker og andre for dyr.

Patogenicitet

Strenge patogene mycobakterier er ansvarlige for specifikke sygdomme:

• Mycobacterium leprae er ansvarlig for spedalskhed  ;
• Mycobacterium ulcerans er ansvarlig for Buruli ulcer , en sygdom klassificeret som en forsømt tropisk sygdom af WHO;
• de fire arter M. tuberculosis , M. bovis , M. canetti og M. africanum er grupperet sammen under navnet tuberculous bacilli og er ansvarlige for tuberculosis ( M. tuberculosis kaldes undertiden et synonym for tuberculosis bacillus, men det er fungerer godt af en art i sig selv);
• Mycobacterium bovis er det forårsagende middel til bovin tuberkulose, men findes i nogle få sjældne tilfælde af infektioner hos mennesker;
• Mycobacterium avium er agenten for aviær tuberkulose;
• "Atypiske" mycobakterier præsenterer mange saprofytiske arter, men også nogle arter, som kan forårsage hos mennesker enten lokale infektioner (kutane eller ganglioniske) eller pseudo-tuberkuløse syndromer, f.eks. : Mycobacterium marinum  ;
• Mycobacterium paratuberculosis eller Johnes bacillus er agenten til enteritis hos kvæg.

Morfologiske tegn

Mikroskopisk morfologi

Mycobakterier fremstår som fine baciller, let buede eller endda forgrenede. De er ubevægelige, blottet for sporer. De har ikke en kapsel i sig selv.

Farvelægning

Disse bakterier er meget dårligt farvede ved konventionelle teknikker, deres lipidrige væg gør det vanskeligt for farvestofferne at trænge ind.

Efter Gram-farvning vises de undertiden Gram-positive, men er ofte ikke observerbare. Denne klassiske farve er derfor ikke af interesse for deres undersøgelse.

Der er udviklet specielle teknikker til at demonstrere karakteren af ​​syre-alkoholresistens, dette er Ziehl-Neelsen- referenceteknikken, hvor bacillerne farves varme med Ziehls fuchsin og derefter bevarer deres røde farve under den kombinerede virkning af en stærk syre og alkohol. Det er en farve, der kan udføres på ca. 20  minutter (15 minutter fuschine, derefter 3 gange 1  minut af Armand-likør).

Andre Colorations også gjort deres udseende: Den Kinyoun og auramin farvning . Fortolkning af resultater bør ikke forveksles med en gram-plet. Med grampletten er resultatet for en gram + bakterie lilla, mens med Kinyoun-pletten er resultatet for et gram + lyserødt.

Kultur

Mykobakterier er grundlæggende differentieret med deres strukturelle karakterer:

• Tuberculosis bacilli ( Mycobacterium tuberculosis , M. bovis , M. africanum ) dyrkes kun på medier, der er egnede til mycobakterier ( Lowenstein-Jensen-medium ), inkuberet ved 37 ° C. kulturerne er langsomme og upigmenterede (mindst 21 dages inkubation).
• Atypiske mycobakterier har færre krav: de kan dyrkes ved temperaturer under 37 ° C og nogle gange endda på sædvanlige medier (hurtigt voksende mycobakterier kendt som atypisk: vækst i 5 til 10 dage).
• Spedalske bacillus ( Mycobacterium leprae ) dyrkes ikke på noget medium.

Kulturer fremstår generelt som kedelige, let kuplede, uregelmæssige og tørre ( ru type ) kolonier . Den Mycobacterium tuberculosis udviser atypisk uregelmæssighed: det er kendt som "blomkål".

Biokemiske og genetiske egenskaber

Mykobakterier er strenge aerober , undertiden mikroaerofile isoleret. De er meget modstandsdygtige over for udtørring, op til et par års overlevelse i tør tilstand og i kulde . Mycobakterier er resistente over for vandopløselige antiseptiske midler (men er følsomme over for fedtopløselige produkter, såsom alkohol, ether). De er resistente over for enzymer fra fagocytter ( lysosomerne indeholder lidt lipase ). I mycobakterier sænkes næringsudvekslingen: mens de fleste pyogene mikrober deler sig en gang hvert 10. til 20. minut, deler tuberkelbacillen en gang hver 10. til 20. time, mens spedalskheden deler sig. En gang hver 20. dag. Dette forklarer den meget langsommere og kroniske karakter af mycobacteriosis.

Den genomet af Mycobacterium tuberculosis er blevet fuldstændig sekventeret  : den har en cirkulær kromosom af 4,411,529 basepar (GC% = 65,6) for 3924 gener .

Et bestemt gen synes essentielt for patogenicitet hos mennesker , et gen fraværende i BCG og Mycobacterium microti . Dette er et gen, der koder for et ESAT-6- protein , udskilt af bakterierne og udløser en stærk produktion af interferon Gamma , kilden til de seneste diagnostiske tests.

Liste over genrer

Ifølge NHSP

Revisionen af ​​slægten Mycobacterium foreslået i 2018 af RS Gupta et al. på basis af molekylære fylogenetiske teknikker er blevet reflekteret opstrøms i Mycobacteriaceae- familien . Oprettelsen af ​​fire nye slægter (angiveligt monofyletiske) gjorde det muligt at modtage et stort antal arter udelukket fra slægten Mycobacterium , som blev konserveret med en reduceret omkreds.

Mycobacteriaceae- familien inkluderer nu følgende slægter:

• Mycobacterium Lehman & Neumann 1896: slægtstype familiebeskrivelse
• Mycolicibacter Gupta et al. 2018 gener. Nov.
• Mycolicibacillus Gupta et al. 2018 gener. Nov.
• Mycolicibacterium Gupta et al. 2018 gener. Nov.
• Mycobacteroides Gupta et al. 2018 gener. Nov.
• Bactoderma Tepper & Korshunova 1973
• Stibiobacter Lyalikova 1974

Selvom offentliggørelsen af ​​navnene som følge af denne omorganisering blev udført i overensstemmelse med de sædvanlige gyldighedskriterier på dette område, mødtes den ikke med støtte fra hele det videnskabelige samfund. Nogle klinikere og medicinske biologer ser uden tvivl om gyldigheden af ​​disse forfatteres arbejde det som en kilde til forvirring og understreger, at de gamle navne forbliver anvendelige.

Ifølge andre kilder

Ifølge NCBI (10. jan. 2011)  :

• Mycobacterium

Ifølge verdensregisteret for marine arter (10. jan. 2011)  :

• slægten Mycobacterium Aronson

Ifølge ITIS (10. januar 2011)  :

• slægten Mycobacterium Aronson

Noter og referencer

1. Gupta RS et al. “Fylogenomics og Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera” Front Microbiol. 2108 feb; 9: 67. Gratis adgang.
2. https://lpsn.dsmz.de/genus/mycobacterium , adgang 01/15/21
3. Oren A & Garrity G “Liste over nye navne og nye kombinationer, der tidligere effektivt, men ikke gyldigt, blev offentliggjort” Int J Syst Evol Microbiol. 2018 maj; 68 (5): 1411-1417. Gratis adgang.
4. Tortoli E et al. "Samme kød, forskellige sovs: ignorer de nye navne på mycobakterier" Eur Respir J. 2019 jul; 54 (1): 1900795. Gratis adgang.
5. Oren A & Trujillo ME “Om gyldig offentliggørelse af navne på mycobakterier” Eur Respir J 2019 okt; 54 (4): 1901483. doi: 10.1183 / 13993003.01483-2019.
6. NCBI , adgang til 10. januar 2011
7. Verdensregister for marine arter, adgang til 10. januar 2011
8. ITIS , adgang 10. januar 2011

eksterne links

• (en) Catalogue of Life Henvisning  : Mycobacteriaceae Chester, 1897 (hørt om11. december 2020)
• (fr + da) ITIS- reference  : Mycobacteriaceae (+ engelsk version )
• (en) Reference Verdensregister for marine arter  : taxon Mycobacteriaceae ( + arterliste )
• (da) NCBI- reference  : Mycobacteriaceae ( taxa inkluderet )

Bibliografi

• LUCAS, F., RADOMSKI, N., MOULIN, L., HAENN, S., BETELLI, L., & CAMBAU, E. (2008). Påvisning af ikke-tuberkuløse mycobakterier i vand . I INVS sundhedsovervågningsdag nov 2008.